生存模型的構建方法包括：1. Lasso回歸；2. Cox多因素回歸；3. 隨機森林；4. 支持向量機 可以把log_rank_test或cox篩選出的基因單獨做模型構建，也...
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TCGA生存模型的構建以及模型預測和評估 -
免疫組庫數據分析1-scRepertoire免疫組庫基礎知識見：單細胞免疫組庫：TCR基因重排原理和TCR測序建庫方法[http://www.itdecent.cn/p/c4896ffadc46] scReperto...
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單細胞SCENIC分析原理和流程介紹SCENIC官網：https://rawcdn.githack.com/aertslab/SCENIC/701cc7cc4ac762b91479b3bd2eaf5ad5661...
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單細胞量化代謝活性-scMetabolism一、scMetabolism的安裝 scMetabolism是一個R包，用于在單細胞分辨率下量化代謝活性，目前只適用于物種是人的單細胞數據。作者推薦使用seurat的數據進行...
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10X單細胞（10X空間轉錄組）基因集打分方法匯總
hello，大家好，今天周一，做一個簡單的匯總，主要針對基因集打分，無論是單細胞還是空間，基因集打分都很普遍，方法也很多，我們來總結一下。 研究背景 在單細胞轉錄組測序中，整...
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單細胞之富集分析-4：分組水平GSVA單細胞富集分析系列： 單細胞之富集分析-1：單細胞GSEA分析流程[http://www.itdecent.cn/p/00f069cb239c] 單細胞之富集分析-2：批量...
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腫瘤免疫相關網頁工具/數據庫
這份提綱是為了《醫(yī)學信息學》這門課的期末presentation準備的。因為自己前期收藏了一些數據分析的網頁工具，所以就順手整理了一下，和大伙兒分享。掛一漏萬，歡迎補充。 腫...
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使用scRepertoire包進行單細胞免疫組庫數據分析簡介 scRepertoire包是由華盛頓大學的Nick Borcherding博士開發(fā)，是一款針對10X V(D)J數據的免疫組庫分析工具。它可以直接讀取10X cellr...
