大家好，好久不見，這個公眾號目前只有我在寫，所有更新隨心所欲，想起來什么就發(fā)點啥，也不為掙錢，希望能跟大家分享一些自己在生信學習中的感受。 上次我們把完整的vcf數(shù)據(jù)提取出來...
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孟德爾隨機化GWAS完整的VCF文件列名都是什么意思 -
Meta分析軟件盤點，做Meta要用哪些軟件？含meta分析軟件安裝包！書接上回，之前我們在《meta分析的基本步驟是什么？附實例講解，7步快速見刊策略》文章里詳細給大家介紹了撰寫一篇Meta分析需要經過哪些步驟。 今天我們就從這些步驟入手，給大...
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GWAS分析-P值和beta值的愛恨相殺 (六)前面已經簡單介紹過GWAS的概念，GWAS分析中所用到的文件以及分析流程，我們在GWAS分析結果文件中經常會看到beta值和P值，他們分別代表什么意思？這兩個值又有什么關系呢...
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集成多組學數(shù)據(jù)的機器學習在生物醫(yī)學中的應用集成多組學數(shù)據(jù)的機器學習在生物醫(yī)學中的應用大綱 機器學習及生物組學基礎（提前贈送視頻） 學習目標：對機器學習基本概念進行介紹，讓大家對機器學習基本概念有大致了解。明確機器學習...
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R機器學習：重復抽樣在機器學習模型建立過程中的地位理解
在做機器學習項目的時候，一開始我們會將數(shù)據(jù)集分為訓練集和測試集，要記住測試集只能用一次，只能用來評估最終最好的模型。如果你反復去使用測試集，反復測試后從里面挑最好的，你就是在...
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散點圖的繪制（spss)一：簡單散點圖（以銷售收入和年輕人人數(shù)為例）（1）步驟：圖形->舊對話框->散點圖->簡單散點圖->定義->加入變量->點擊確定（2）會出現(xiàn)如圖所示界面（按圖中所示加入變量）...
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WGCNA得到模塊之后如何篩選模塊里面的hub基因
WGCNA得到模塊之后如何篩選模塊里面的hub基因 原創(chuàng) 生信技能樹 我在生信技能樹多次寫教程分享WGCNA的實戰(zhàn)細節(jié)，見： 一文看懂WGCNA 分析(2019更新版)[ht...
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R語言 Logistic回歸~模型構建
線性回歸模型是研究連續(xù)型變量與一組自變量之間的關系。也就是說線性回歸模型的因變量是連續(xù)型變量。如果因變量是分類變量，則是非線性的，此時需要用Logistic回歸，對其發(fā)生概率...
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【GEO數(shù)據(jù)庫挖掘】四、差異分析（limma）、繪圖和富集分析參考代碼在這： 1 差異分析 需要的數(shù)據(jù)：表達矩陣、分組矩陣、差異比較矩陣 至此獲得了差異分析矩陣nrDEG 2 繪圖 2.1 熱圖 可以查看到高表達和低表達的基因。 2.2...
