使用cBioPortal進(jìn)行復(fù)雜的癌癥基因組和臨床profiles整合分析(Y大寬原創(chuàng),轉(zhuǎn)載需要說明) 主要來自于doi:10.1158/2159-8290.CD-12-00...
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使用cBioPortal進(jìn)行復(fù)雜的癌癥基因組和臨床profiles整合分析(Y大寬原創(chuàng),轉(zhuǎn)載需要說明) 主要來自于doi:10.1158/2159-8290.CD-12-00...
前言 前面,我們介紹過了差異基因的功能富集分析,今天,我們對這部分的內(nèi)容作一些補充 主要介紹一下 GEVA、ssGSEA 和單基因的富集分析 GSVA 我們知道,GSEA 富...
zhuang_gj 2020/10/11 ssGSEA算法原理及應(yīng)用[#ssgsea%E7%AE%97%E6%B3%95%E5%8E%9F%E7%90%86%E5%8F%8A...
通過exprs函數(shù)獲取表達(dá)矩陣后我們可以通過以下三種方法判斷是否需要進(jìn)行l(wèi)og2轉(zhuǎn)換 1.肉眼識別 最簡單粗暴的方法就是,根據(jù)數(shù)值大小粗略估計:如果表達(dá)量的數(shù)值在50以內(nèi),通...
前言 在處理數(shù)據(jù)的時候,經(jīng)常會遇到兩個名詞Scale和Normalization,這兩個名詞經(jīng)常會被混雜著使用,讓我在理解一些操作的時候經(jīng)常會迷糊,那么我就結(jié)合R語言里面的s...
出來畫圖,難免碰到個畫箭頭的需求。 簡單,如下的代碼就能安排。 畫箭頭時一些調(diào)整和參數(shù)設(shè)置,可以參考如下代碼,看看箭頭的頭和尾的圓或者鈍怎么設(shè)置。