TCGA數(shù)據(jù)庫中含有的癌癥名稱，簡寫和中文名稱 Abbr英文名稱中文名稱ACCAdrenocortical carcinoma腎上腺皮質(zhì)癌BLCABladder Urothe...
發(fā)簡信
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TCGA / 癌癥簡稱 / 縮寫 / TCGA癌癥中英文對照
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org.Hs.eg.db 包的使用jimmy布置的個R語言中級作業(yè)中提到了幾個R包，我查找了Bioconductor中org.Hs.eg.db包的使用說明書，為了自己更好的理解和應(yīng)用，做了以下筆記。 首先了解...
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GSEA 富集分析理論知識 GSEA（Gene Set Enrichment Analysis），該方法發(fā)表于2005年的Gene set enrichment analysis: a kno...
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2021-09-25。惋惜，Oncomine將于2022年1月17日終止服務(wù)
如題，芒果必須告知各位果友這個不幸的消息——Oncomine數(shù)據(jù)平臺將于2022年1月17日終止服務(wù)。關(guān)于Oncomine平臺的離場，芒果很傷心，也很惋惜！ 但是，現(xiàn)實(shí)總是殘...
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表達(dá)譜分析組織中細(xì)胞組分情況 --- CIBERSORT & xCell腫瘤微環(huán)境是近年來的研究熱點(diǎn)。復(fù)雜而動態(tài)的微環(huán)境中，腫瘤細(xì)胞與浸潤性免疫細(xì)胞、基質(zhì)細(xì)胞等相互作用，這在促進(jìn)或抑制腫瘤生長、侵襲、轉(zhuǎn)移以及對病人臨床預(yù)后方面可能具有多方面的影響...
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GSEA富集分析學(xué)習(xí)筆記
教程https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI5MTcwNjA4NQ==&mid=2247484582&idx=1&sn=1e01276e121...
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復(fù)現(xiàn)：純R代碼實(shí)現(xiàn)ssGSEA算法評估腫瘤免疫浸潤程度最近學(xué)習(xí)了生信菜鳥團(tuán)的純R代碼實(shí)現(xiàn)ssGSEA算法評估腫瘤免疫浸潤程度,想復(fù)制作者的流程，但是發(fā)現(xiàn)了幾個不一樣的地方，所以重新整理流程，代碼主要來自原作者Juan_NF。 文...
