最近開(kāi)始使用RSS服務(wù),為我節(jié)省了不少時(shí)間,而且可以關(guān)注自己喜歡的新聞,博客,作者,網(wǎng)站等,比較私人。心血來(lái)潮,想跟大家分享一下,先整理最近使用的這些,因?yàn)閷?duì)美食/教育/健康...
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在諸如:ChIP-seq、ATAC-seq、MeRIP-seq(m6A)、Cut&Tag中我們常常聽(tīng)到一個(gè)詞Call Peak。Call Peak究竟是什么東西,得到的結(jié)果又...
圖例 默認(rèn)情況下,熱圖和簡(jiǎn)單注釋會(huì)自動(dòng)生成圖例,生成的圖例放在熱圖的右側(cè)。復(fù)雜注釋沒(méi)有圖例,但可以手動(dòng)構(gòu)建和添加它們。所有圖例都是由構(gòu)造函數(shù)Legend()內(nèi)部構(gòu)造的 。在后...
前兩期scRNA-seq分享講到了測(cè)序的原理、應(yīng)用以及測(cè)序方法,今天就進(jìn)入了數(shù)據(jù)分析階段了。scRNA-seq 與 bulk -RNA-seq 同樣是RNA的通量測(cè)序數(shù)據(jù),在...
Seurat從3.0版本引進(jìn)了SCTransform這個(gè)函數(shù)用來(lái)對(duì)數(shù)據(jù)做標(biāo)準(zhǔn)化,并且這一個(gè)函數(shù)可以代替三個(gè)函數(shù)(NormalizeData, ScaleData, FindV...
獲取Seurat氣泡圖的繪圖數(shù)據(jù) 創(chuàng)建x軸分類標(biāo)簽注釋 將注釋添加到data.usage方便繪圖調(diào)用 根據(jù)需求重排y軸繪圖標(biāo)簽順序 重繪氣泡圖并基于facet分面方法為x軸添...
看文獻(xiàn)是經(jīng)常發(fā)現(xiàn)有堆疊柱狀圖+百分比展示的例子,下面就來(lái)復(fù)現(xiàn)下這樣的圖形。下圖中的C圖。 以IMvigor210免疫治療隊(duì)列數(shù)據(jù)為例: 1.輸入數(shù)據(jù) 輸入數(shù)據(jù)rt是兩個(gè)因子變...
??單細(xì)胞文章層出不重,但是數(shù)據(jù)格式不統(tǒng)一,卡卡在重現(xiàn)大量文章數(shù)據(jù)的時(shí)候發(fā)現(xiàn),有的文章提供的是處理后的單細(xì)胞矩陣,而不是原始counts,甚至有的文章提供的數(shù)據(jù)是scaled...