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發(fā)簡信
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思路清奇SCI:16.前列腺癌+微生物.12.1分前列腺癌和腸道菌群竟然存在著密切的聯(lián)系，下面就來圍觀下這篇文獻吧。 發(fā)表雜志：Nature Communications PMID： 摘要 背景 醋酸阿比特龍（Abirate...
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logistic回歸系列
1、常用的總結(jié)性函數(shù) summary()展示擬合模型細(xì)節(jié)coefficients()coef()列出擬合模型的參數(shù)（截距項和斜率）confint()給出模型參數(shù)的置信區(qū)間（默...
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TCGA轉(zhuǎn)錄組差異分析后多種基因功能富集分析：從GO/KEGG到GSEA和GSVA/ssGSEA（含基因ID轉(zhuǎn)換）測序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw r...
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這個套路有原文嘛？
套路分享：利用TCGA數(shù)據(jù)庫進行免疫細(xì)胞浸潤相關(guān)生信數(shù)據(jù)挖掘
本文作者毛細(xì)血管，研究方向腫瘤學(xué)，目前主要在學(xué)習(xí)生信數(shù)據(jù)挖掘和腫瘤免疫微環(huán)境等，在后面的分享過程中主要分享自己學(xué)到的生信方面操作以及腫瘤免疫微環(huán)境相關(guān)的文獻解讀，現(xiàn)已發(fā)表me...
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R語言出現(xiàn)的小錯誤及解決方法總結(jié)發(fā)現(xiàn)問題通用小技巧： 1.用？查看包2.用？？查看函數(shù)3.百度翻譯錯誤代碼問題4.百度相關(guān)問題或函數(shù)看是否有類似（最根本的還是根據(jù)其提示的錯誤，和你需要運行的代碼的原理去調(diào)整...
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TCGA數(shù)據(jù)下載與整理-TCGAbiolinks包
寫在前面，如果不是R語言高手，建議利用網(wǎng)站下載個人愛好——1、官網(wǎng)：https://portal.gdc.cancer.gov[https://portal.gdc.canc...
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Heatmap——熱圖那些事
1.用gplots-heatmap.2畫熱圖， 注腳：scale標(biāo)準(zhǔn)化，根據(jù)每列或者行數(shù)據(jù)的均值標(biāo)準(zhǔn)化,主要是為了防止單個數(shù)據(jù)過大（過?。?，導(dǎo)致冷熱色分布不明顯的現(xiàn)象，可選r...
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R語言畫table-三線圖
#常規(guī)清空，加載包 rm(list = ls())library(table1)library(lubridate)setwd("D:\\生信課題\\R語言畫圖\\R語言統(tǒng)計...
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喜歡寫代碼的外科醫(yī)生。
