綜合簡(jiǎn)書(shū)作者們的文章以及自己操作，綜合整理如下，以備后面使用。有問(wèn)題歡迎交流Robust enumeration of cell subsets from tissue ex...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：浙江
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【塊】Cibersort.R計(jì)算22種免疫細(xì)胞浸潤(rùn)分?jǐn)?shù) -
CIBERSORT免疫浸潤(rùn)的R實(shí)現(xiàn)
CIBERSORT免疫浸潤(rùn)的代碼實(shí)現(xiàn) (qq.com)[https://mp.weixin.qq.com/s/FMejgtuEsRi93aRooeTaLQ] 數(shù)據(jù)直接從xen...
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CPTAC蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)的使用CPTAC數(shù)據(jù)庫(kù)（https://cptac-data-portal.georgetown.edu/datasets[https://cptac-data-portal.ge...
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跟著Cell學(xué)作圖：R語(yǔ)言ggplot2作圖展示差異表達(dá)的基因一組對(duì)照加處理這種實(shí)驗(yàn)的差異表達(dá)分析結(jié)果通常是用火山圖來(lái)展示，如果是很多組實(shí)驗(yàn)的話如何展示，這種情況我之前還沒(méi)有遇到過(guò)。公眾號(hào)后臺(tái)有讀者留言問(wèn)到了如下的圖 這個(gè)圖來(lái)自于論文A...
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3大差異分析r包：DESeq2、edgeR和limma做差異分析需要的數(shù)據(jù)：表達(dá)矩陣和分組信息TCGA的數(shù)據(jù)只要表達(dá)矩陣就夠了，因?yàn)槠銽CGA的樣本ID比較特殊，樣本ID的第14和15位是>=10還是<10就代表了這個(gè)樣本是正常...
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R包的安裝總結(jié)
一、CRAN安裝R包：install.packages()函數(shù) 1、單個(gè)包的安裝：install.packages("ggplot2") 第一種 第二種：Rstudio上點(diǎn)擊...
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R語(yǔ)言缺失值（NA）的去除
1、na.omit 上述代碼會(huì)將所有含NA的行去除但有的時(shí)候不需要將所有NA行去除，而是某一列含有NA的行 2、!="NA" 來(lái)源
