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可能是最全的單細胞數(shù)據(jù)庫匯總（2023更新版本）
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R繪圖(4): 散點圖添加相關(guān)系數(shù)/回歸方程
屬于比較常用的技巧。下面我用ggplot2內(nèi)置數(shù)據(jù)集進行演示： 先來看一下，僅有散點和擬合線的圖 如果想添加擬合的方程，可以使用ggpmisc包的stat_poly_eq()...
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ggplot散點圖加相關(guān)系數(shù)計算一組數(shù)據(jù)有沒有相關(guān)性以及相關(guān)程度時，可以使用cor()，以及cor.test()計算顯著性，如下所示，我們想計算這兩種花的長度有沒有相關(guān)性。 我們可以手動將計算的相關(guān)系數(shù)...
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第2周：RNA-seq數(shù)據(jù)分析最佳實踐原文來源：Conesa A, Madrigal P, Tarazona S, et al. A survey of best practices for RNA-seq da...
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maSigpro建模代碼分析之make.design.matrix前言 之前我們介紹了maSigpro的基本建模方式：分析時間序列的RNA-seq tool[http://www.itdecent.cn/p/ad76dcfdf840]，這...
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【陳巍學(xué)基因-4】單細胞DNA測序
歡迎關(guān)注公眾號：oddxix 自從二代測序技術(shù)出現(xiàn)，把一次實驗測許多條DNA序列的這個難題解決之后，一次把一個人的全基因組給測出來，最極限的情況，就是樣本量就是少到一個細胞，...
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55-caret包學(xué)習(xí)：預(yù)處理函數(shù)1、創(chuàng)建虛擬變量 caret包通過model.matrix()、dummyVars()或其他方式將因子轉(zhuǎn)換為虛擬變量。dummyVars()可用于從一個或多個因子變量生成一個...
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58-caret包應(yīng)用簡短實例Caret包(即Classification And REgression Training的縮寫)，包含簡化復(fù)雜的回歸和分類問題模型訓(xùn)練過程的功能。 1、導(dǎo)入數(shù)據(jù)并分割數(shù)據(jù)...
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57-caret包支持訓(xùn)練的模型及其參數(shù)列表
來源：http://topepo.github.io/caret/available-models.html 模型method 值類型依賴包調(diào)優(yōu)參數(shù)AdaBoost Clas...
