Human cell atlas, HCA:https://data.humancellatlas.org/[https://data.humancellatlas.org/...
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屬于比較常用的技巧。下面我用ggplot2內(nèi)置數(shù)據(jù)集進(jìn)行演示: 先來(lái)看一下,僅有散點(diǎn)和擬合線的圖 如果想添加擬合的方程,可以使用ggpmisc包的stat_poly_eq()...
計(jì)算一組數(shù)據(jù)有沒(méi)有相關(guān)性以及相關(guān)程度時(shí),可以使用cor(),以及cor.test()計(jì)算顯著性,如下所示,我們想計(jì)算這兩種花的長(zhǎng)度有沒(méi)有相關(guān)性。 我們可以手動(dòng)將計(jì)算的相關(guān)系數(shù)...
原文來(lái)源:Conesa A, Madrigal P, Tarazona S, et al. A survey of best practices for RNA-seq da...
前言 之前我們介紹了maSigpro的基本建模方式:分析時(shí)間序列的RNA-seq tool[http://www.itdecent.cn/p/ad76dcfdf840],這...
歡迎關(guān)注公眾號(hào):oddxix 自從二代測(cè)序技術(shù)出現(xiàn),把一次實(shí)驗(yàn)測(cè)許多條DNA序列的這個(gè)難題解決之后,一次把一個(gè)人的全基因組給測(cè)出來(lái),最極限的情況,就是樣本量就是少到一個(gè)細(xì)胞,...
1、創(chuàng)建虛擬變量 caret包通過(guò)model.matrix()、dummyVars()或其他方式將因子轉(zhuǎn)換為虛擬變量。dummyVars()可用于從一個(gè)或多個(gè)因子變量生成一個(gè)...
Caret包(即Classification And REgression Training的縮寫(xiě)),包含簡(jiǎn)化復(fù)雜的回歸和分類(lèi)問(wèn)題模型訓(xùn)練過(guò)程的功能。 1、導(dǎo)入數(shù)據(jù)并分割數(shù)據(jù)...
來(lái)源:http://topepo.github.io/caret/available-models.html 模型method 值類(lèi)型依賴(lài)包調(diào)優(yōu)參數(shù)AdaBoost Clas...