Human cell atlas, HCA：https://data.humancellatlas.org/[https://data.humancellatlas.org/...
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可能是最全的單細(xì)胞數(shù)據(jù)庫(kù)匯總（2023更新版本）
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R繪圖(4): 散點(diǎn)圖添加相關(guān)系數(shù)/回歸方程
屬于比較常用的技巧。下面我用ggplot2內(nèi)置數(shù)據(jù)集進(jìn)行演示： 先來(lái)看一下，僅有散點(diǎn)和擬合線的圖 如果想添加擬合的方程，可以使用ggpmisc包的stat_poly_eq()...
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ggplot散點(diǎn)圖加相關(guān)系數(shù)計(jì)算一組數(shù)據(jù)有沒(méi)有相關(guān)性以及相關(guān)程度時(shí)，可以使用cor()，以及cor.test()計(jì)算顯著性，如下所示，我們想計(jì)算這兩種花的長(zhǎng)度有沒(méi)有相關(guān)性。 我們可以手動(dòng)將計(jì)算的相關(guān)系數(shù)...
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第2周：RNA-seq數(shù)據(jù)分析最佳實(shí)踐原文來(lái)源：Conesa A, Madrigal P, Tarazona S, et al. A survey of best practices for RNA-seq da...
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maSigpro建模代碼分析之make.design.matrix前言 之前我們介紹了maSigpro的基本建模方式：分析時(shí)間序列的RNA-seq tool[http://www.itdecent.cn/p/ad76dcfdf840]，這...
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【陳巍學(xué)基因-4】單細(xì)胞DNA測(cè)序
歡迎關(guān)注公眾號(hào)：oddxix 自從二代測(cè)序技術(shù)出現(xiàn)，把一次實(shí)驗(yàn)測(cè)許多條DNA序列的這個(gè)難題解決之后，一次把一個(gè)人的全基因組給測(cè)出來(lái)，最極限的情況，就是樣本量就是少到一個(gè)細(xì)胞，...
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55-caret包學(xué)習(xí)：預(yù)處理函數(shù)1、創(chuàng)建虛擬變量 caret包通過(guò)model.matrix()、dummyVars()或其他方式將因子轉(zhuǎn)換為虛擬變量。dummyVars()可用于從一個(gè)或多個(gè)因子變量生成一個(gè)...
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58-caret包應(yīng)用簡(jiǎn)短實(shí)例Caret包(即Classification And REgression Training的縮寫(xiě))，包含簡(jiǎn)化復(fù)雜的回歸和分類(lèi)問(wèn)題模型訓(xùn)練過(guò)程的功能。 1、導(dǎo)入數(shù)據(jù)并分割數(shù)據(jù)...
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57-caret包支持訓(xùn)練的模型及其參數(shù)列表
來(lái)源：http://topepo.github.io/caret/available-models.html 模型method 值類(lèi)型依賴(lài)包調(diào)優(yōu)參數(shù)AdaBoost Clas...
