主成分分析,不只需要找到幾個虛擬但不知具體為何物的主成分因子,還需要知道我們提供的變量在各個主成分因子上的載荷(有正有負)和貢獻度,以及具體保留多少個主成分因子才能既盡量保留...
0.文章 文章標題:Characterization of an endoplasmic reticulum stress‐related signature to eval...
前陣子因為指標踩了很多坑,花了很多時間, 我想還是有必要總結(jié)一下, 梳理一下知識點啥的... 從classification開始說起. 只要在網(wǎng)上查一下分類模型評價指標, 基...
之前的文章里已經(jīng)按照教程進行了TCGA數(shù)據(jù)庫的一些練習(RNA-seq、芯片、生存分析),現(xiàn)在學習TCGA甲基化數(shù)據(jù)的分析過程。 參考文章:1.甲基化的一些基礎知識2.Mak...
來源:https://cloud.tencent.com/developer/article/1189476 基礎知識 首先我們了解一些基礎知識(注:文中圖片皆可點擊放大查看...
和甲基化有關的。可以先了解下甲基化:450k甲基化基礎450K甲基化芯片數(shù)據(jù)處理傳送門450k甲基化芯片常用工具包:ChAMP和minfi等。 甲基化的一些預備知識甲基化程度...
由于上次寫完教程一后還有許多疑問還沒解決,在師兄的建議下看了一下R包中核心函數(shù)的源碼(到底在做什么回歸?),大概解開了心中的部分疑惑。最近在看很多問題時候,總會有些急躁,反而...
這篇文獻是今年的11月發(fā)表在Nature reviews上的一篇綜述,題目是The epigenetic basis of cellular heterogeneity。主要...