clusterProfiler 是業(yè)界大神Y叔寫的一個(gè)R包，可以用來(lái)做各種富集分析，如GO、KEGG、DO（Disease Ontology analysis）、Reacto...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：浙江
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GEO數(shù)據(jù)挖掘小嘗試：（三）利用clusterProfiler進(jìn)行富集分析 -
自動(dòng)化辦公：python操作Excel1.安裝 2.操作一個(gè)簡(jiǎn)單的Excel文檔 操作注釋及代碼： 操作完成后，數(shù)據(jù)存儲(chǔ)結(jié)果如下： 3. 操作簡(jiǎn)單Excel文檔并添加數(shù)據(jù)格式 操作代碼如下：附帶數(shù)據(jù)格式的定義...
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用Python設(shè)計(jì)PCR引物: Primer3-py 初識(shí)
PCR引物設(shè)計(jì)應(yīng)該算是生物實(shí)驗(yàn)基本技能吧，工具也非常多。Primer-BLAST、Primer Premier 都是比較經(jīng)典的軟件，除此之外還有很多新的在線設(shè)計(jì)軟件，也很方便...
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幾款計(jì)算測(cè)序深度和覆蓋度的軟件或模塊1. BAMStats BAMStats是一款從BAM文件中計(jì)算覆蓋度和其他數(shù)據(jù)，并生成這些數(shù)據(jù)的描述性統(tǒng)計(jì)的工具 1.1 安裝 1.2 使用 java -jar BAMSt...
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臨床生信實(shí)操（centos7）2尋找trio家系新發(fā)突變位點(diǎn) http://wintervar.wglab.org/錯(cuò)義突變?cè)u(píng)估網(wǎng)站突變r(jià)eads占總reads的比例，看父母結(jié)果，輔助判斷。在/home/D...
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轉(zhuǎn)錄組入門（7）：差異表達(dá)分析這個(gè)步驟推薦在R里面做，載入表達(dá)矩陣，然后設(shè)置好分組信息，統(tǒng)一用DEseq2進(jìn)行差異分析，當(dāng)然也可以走走edgeR或者limma的voom流程?；救蝿?wù)是得到差異分析結(jié)果，進(jìn)...
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ID轉(zhuǎn)換那點(diǎn)事
在進(jìn)行測(cè)序數(shù)據(jù)下游分析的時(shí)候常常需要用到不同的數(shù)據(jù)庫(kù)，而這些數(shù)據(jù)庫(kù)的分析的輸入文件經(jīng)常是各有區(qū)別，因此我們常常需要將各類ID（ensamble ID、Entrez ID、ge...
