參考： [1]. Durand, N.C., et al., Juicer Provides a One-Click System for Analyzing Loop...
IP屬地：吉林
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Juicer:Hi-C數(shù)據(jù)處理分析（一） -
Structure圖的生成實(shí)戰(zhàn)
Structure分析當(dāng)然最經(jīng)典的軟件就是STRUCTURE。但Structure分析還有其他軟件可以選擇: ADMIXTURE、FRAPPE。這兩個(gè)軟件的運(yùn)行速度都大大超過...
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「文獻(xiàn)」多倍體植物基因組測序組裝當(dāng)前策略
「文獻(xiàn)」多倍體植物基因組測序組裝當(dāng)前策略 文獻(xiàn)地址: Current Strategies of Polyploid Plant Genome Sequence Assemb...
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從零開始學(xué)CIRCOS繪制圈圖(五)這一部分承接 從零開始學(xué)CIRCOS繪制圈圖(四)，對之前的布局進(jìn)行調(diào)整，使結(jié)構(gòu)更加適合于發(fā)表。 染色體的位置順序 默認(rèn)情況下是會(huì)顯示所有的染色體，而且會(huì)先從ath1到ath...
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從零開始學(xué)CIRCOS繪制圈圖(二)在從零開始學(xué)Circos繪制圈圖（一）我們已經(jīng)繪制出一個(gè)比較丑的circos圖，這一部分是講解一些細(xì)節(jié)。 這一部分會(huì)從上一步的兩個(gè)文件開始，分別是 karyotype.tai...
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從零開始學(xué)CIRCOS繪制圈圖(三)這一篇會(huì)在 從零開始學(xué)CIRCOS繪制圈圖(二)基礎(chǔ)上開始在circos繪制基因密度信息。為了保證一致性，可以新建如下幾個(gè)文件 circos.conf: karyotype....
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從零開始學(xué)Circos繪制圈圖（一）一般基因組文章都會(huì)有下面這種酷炫圖，用來描述基因組的基因密度分布，轉(zhuǎn)座子的密度分布，和其他物種或者多倍體的多套染色體間的共線性關(guān)系，以及其他各種你只要測序就能加上的信息，比如...
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群體遺傳筆記（一）：群體間選擇信號(hào)的檢測及GO注釋從獲取下機(jī)數(shù)據(jù)做質(zhì)控、比對，到calling snp獲得vcf文件這一步，網(wǎng)上已經(jīng)有非常詳細(xì)的教程，有GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實(shí)踐（上），還有Samtools+bcf...
個(gè)人介紹
西澳大學(xué)生物信息博士一枚
研究方向: 植物泛基因組與群體基因組學(xué)的挖掘
簡信不回答問題，有問題發(fā)至
lakeseafly50@gmail.com
研究方向: 植物泛基因組與群體基因組學(xué)的挖掘
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