Basic local alignment search tool (BLAST) 包括：blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等....
IP屬地：北京
-
這或許是我寫的最全的BLAST教程 -
基因組De novo組裝和 ALLPATHS-LG使用理論部分 該部分參考及引用陳連福的生信講義，zhaofei的https://vip.biotrainee.com/d/103--。 由于儀器測序讀長的限制等，在建庫時(shí)會(huì)將DN...
-
gatk-4.1.9.0/gatk VariantFiltration warnings
15:55:13.094 WARN JexlEngine - ![0,14]: 'ReadPosRankSum < -8.0;' undefined variable Re...
-
@蒂姆小山 可以，重要的是混池的突變體表型準(zhǔn)確。
水稻BSA之利用Mutmap快速進(jìn)行基因定位
許多重要的農(nóng)藝性狀為數(shù)量性狀，由多個(gè)基因位點(diǎn)控制。利用傳統(tǒng)的分子標(biāo)記技術(shù)進(jìn)行基因定位，常常需要花費(fèi)較長的時(shí)間和大量的人力物力。2012年日本巖手大學(xué)（Iwate univer...
-
分享生命科學(xué)實(shí)用干貨、前沿技術(shù)，您最佳的學(xué)習(xí)小助手~
-
R語言手動(dòng)計(jì)算Tajima's D 和 Fst原理和公式參考： http://www.itdecent.cn/p/c7ba1aa543fe[http://www.itdecent.cn/p/c7ba1aa543fe]...
-
R ggplot2繪制堆疊柱狀圖STEP1：了解數(shù)據(jù)特征 STEP2：整理數(shù)據(jù)（變成長數(shù)據(jù)） STEP3：畫圖 STEP3.1：基本圖形 STEP3.2：改顏色 STEP3.3：改標(biāo)簽 STEP3.4：數(shù)值...
-
統(tǒng)計(jì)fastq文件read長度及read平均長度
轉(zhuǎn)錄組分析使用stringtie定量后，如果使用DESeq2進(jìn)行下游分析，需要使用prepDE.py生成read counts矩陣，prepDE.py需要fastq文件的re...
-
修改stringtie、ballgown 結(jié)果中部分gene_id為ref_gene_id
問題：stringtie組裝轉(zhuǎn)錄本后會(huì)改變原本參考基因組注釋文件中的gene_id stringtie 組裝、merge的stringtie_merged.gtf注釋文件中的...
-
MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負(fù)了努力
-
多行命令并行管理，只需要一個(gè)腳本在上游分析中，多個(gè)樣本常常要同時(shí)分析，為了節(jié)省時(shí)間我們常常會(huì)通過寫一個(gè)簡單的腳本去運(yùn)行。 比如對于這樣的一個(gè)accessionlist，樣本數(shù)較少 我們先寫一個(gè)比對的腳本 重...
-
-
TaWRKY19 抑制TaNOX10表達(dá)，降低ROS反應(yīng)，降低小麥條銹病抗性One-sentence summary:TaWRKY19 transcriptionally represses the expression ofTaNOX10, imp...
