雷達(dá)圖繪制 （1）ggplot2簡(jiǎn)約版雷達(dá)圖 library(ggplot2) dt = data.frame(A2 = c(0, 3.33, 3.25, 2.29, 0,2...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：浙江
-
基因家族分析全套軟件
基因家族生物信息學(xué)分析 （1）基因家族分析概述 旁系同源基因 基因家族可通過(guò)基因復(fù)制進(jìn)行物種特異性擴(kuò)增，主要有染色體片段復(fù)制、串聯(lián)復(fù)制和反轉(zhuǎn)錄子轉(zhuǎn)座等三種形式，可能導(dǎo)致功能丟...
-
基因組注釋理論基礎(chǔ)
基因組注釋主要包括四個(gè)方面： 重復(fù)序列識(shí)別 序列比對(duì)方法 RepeatScout、LTR-finder、Tendem Repeat Finder、Piler、Repe...
-
RepeatModeler + RepeatMasker
在基因組注釋中第一步就是重復(fù)序列的屏蔽，目前常用的從頭注釋pipeline就是RepeatModeler + RepeatMasker。 1. 軟件安裝 RepeatMask...
-
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組擴(kuò)增技術(shù)
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序方法詳解 1 Smart-seq2（擴(kuò)增全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組） 通過(guò)ployT抓取，只能檢測(cè)mRNA。 Smart-seq2步驟: 1通過(guò)ployT抓取，加入SMART...
-
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化--Normalization轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)比對(duì)到參考基因組獲得對(duì)應(yīng)基因count值后，因?yàn)闇y(cè)序深度以及基因長(zhǎng)度的關(guān)系，在進(jìn)行差異分析之前，還需要進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。標(biāo)準(zhǔn)化是轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)差異分析必不可少的一步。 用...