生物數(shù)據(jù)庫(kù) 基本序列格式 1.FASTA格式：首行為描述行，以>為起始，其后為描述信息；第二行即為原始序列。2.FASTQ格式:FASTQ格式包括四部分信息：第一行為包含序列...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：寧夏
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生物數(shù)據(jù)庫(kù)
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T細(xì)胞受體庫(kù)測(cè)序T細(xì)胞受體是T細(xì)胞識(shí)別靶細(xì)胞表面特異性抗原的蛋白分子，由α鏈和β鏈（分別由TRA和TRB編碼）或者γ鏈和δ 鏈（分別由TRG和TRD編碼）構(gòu)成的異二聚體，主要是以α鏈和β鏈構(gòu)...
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ChIP-seq基礎(chǔ)入門理解ChIP-Seq 到了目前這個(gè)水平，我學(xué)習(xí)新的高通量數(shù)據(jù)分析流程時(shí)已經(jīng)不再考慮代碼應(yīng)該如何寫的問題了。我更多要去考慮一個(gè)技術(shù)的目的和意義。 轉(zhuǎn)錄組主要研究的問題是基因在不...
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表觀遺傳學(xué)-組蛋白修飾一、染色體簡(jiǎn)介 DNA Packing 1、如何將10,000公里長(zhǎng)的蠶絲(半徑~10e-5米)裝入一個(gè)籃球中。2、蠶絲的體積：3.14*10e-3 m33、折疊、纏繞......
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表達(dá)譜分析組織中細(xì)胞組分情況 --- CIBERSORT & xCell腫瘤微環(huán)境是近年來的研究熱點(diǎn)。復(fù)雜而動(dòng)態(tài)的微環(huán)境中，腫瘤細(xì)胞與浸潤(rùn)性免疫細(xì)胞、基質(zhì)細(xì)胞等相互作用，這在促進(jìn)或抑制腫瘤生長(zhǎng)、侵襲、轉(zhuǎn)移以及對(duì)病人臨床預(yù)后方面可能具有多方面的影響...
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Cre-LoxP條件性基因編輯系統(tǒng)--學(xué)習(xí)筆記背景 Cre/LoxP系統(tǒng)來源于F1噬菌體，是非常經(jīng)典有效的基因編輯技術(shù)。 1. 什么是Cre Cre重組酶(cyclizationrecombination)，它是一種由3...
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「r<-包」UCSCXenaTools: Retrieve Gene Expression and Clinical Information from UCSC Xena for Surviva...The UCSC Xena platform provides an unprecedented resource for public omics data from bi...
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11 生存模型的C-index
現(xiàn)階段用的最多的是腫瘤患者預(yù)后模型的預(yù)測(cè)精度。 C-index，C指數(shù)即一致性指數(shù)（index of concordance），用來評(píng)價(jià)模型的預(yù)測(cè)能力。c指數(shù)是資料所有病人對(duì)...
