0.寫在前面 從我學(xué)生信開始，畫熱圖用的就是pheatmap，有時復(fù)雜化的需求會用到ComplexHeatmap。作為R語言畫圖的絕對霸主，ggplot2的熱圖卻無法在熱圖的...
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披著ggplot皮的pheatmap,深夜激動更新我的包 -
甲基化芯片數(shù)據(jù)的差異分析火山圖有誤，已更新 前情提要 前面兩個步驟已經(jīng)完成了數(shù)據(jù)下載、探針過濾、數(shù)據(jù)質(zhì)控、樣本過濾。 此處需要補充兩個知識點： beta值的生物學(xué)意義 beta>=0.6 完全甲基化...
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生存分析，簡單粗暴！生存分析代碼的原始版本見：兩種方法批量生存分析，這個是R包GDCRNATools給出的簡化版。大段代碼變成幾個函數(shù)搞定。 0.R包和數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 1.差異分析 可以獲取全部差異基...
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弦圖，管他中不中用，反正高大上0.準(zhǔn)備輸入數(shù)據(jù) 可以是矩陣 行是一邊，列是一邊，矩陣正文的數(shù)字表示連接的強度。 可以是tidy數(shù)據(jù)框 一行是一個連接關(guān)系，第一列和第二列是要連接的兩邊，第三列是連接的強度。...
