《我在北京送快遞》胡安焉之前看了《在工作中看到中國(guó)》，以為這本可能是跟風(fēng)出了本書。連續(xù)幾周在豆瓣排行榜上，前天拿來看看。我以為作者是農(nóng)村出身，去送快遞，竟不想父母是事業(yè)單位。...
IP屬地：天津
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bedtools的使用--------------- ################# Nickier 2018-12-14 ################# --------------- ...
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《親密關(guān)系》讀書筆記第一章 人際關(guān)系的構(gòu)成 1.親密關(guān)系的性質(zhì)和重要性 2.文化影響 親密關(guān)系變化的根源（個(gè)人覺得這段有趣） 經(jīng)濟(jì)發(fā)展：影響因素涉及經(jīng)濟(jì)發(fā)展。社會(huì)工業(yè)化程度越高、越富足，越能接納...
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SARS-CoV-2刺突蛋白抗體疫苗應(yīng)答與癌癥患者感染嚴(yán)重程度的相關(guān)性——全國(guó)COVID癌癥橫斷面評(píng)估1.研究背景： 盡管新冠肺炎疫苗接種率高，但SARS-CoV-2大流行依然是一個(gè)醫(yī)療問題。與普通人群中SARS-CoV-2的免疫和保護(hù)水平有所不同，一些群體面臨著極端風(fēng)險(xiǎn)。免...
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@心驚夢(mèng)醒 好嘞，謝謝大佬~感謝~
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這個(gè)問題不影響結(jié)果是么？
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藥物警戒的數(shù)據(jù)挖掘比例失衡分析算法(DPA) 1.頻數(shù)類藥物不良反應(yīng)挖掘算法 a代表目標(biāo)藥物的目標(biāo)不良反應(yīng)報(bào)告數(shù)b代表目標(biāo)藥品的其他不良反應(yīng)報(bào)告數(shù)c代表非目標(biāo)藥品的目標(biāo)不良反應(yīng)報(bào)告數(shù)d代表非目...
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ctDNA指導(dǎo)帕尼單抗在轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌中的再用藥： 2期CHRONOS臨床試驗(yàn)1.研究背景抗表皮生長(zhǎng)因子受體（EGFR）單克隆抗體已被批準(zhǔn)用于RAS野生型（WT）轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌（mCRC）的治療，但最初受益于EGFR阻斷的患者幾乎總是會(huì)產(chǎn)生耐藥性。從分...
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Q: Should I always do smoothing, even for RRBS data?
A: Smoothing is always recommended, even for RRBS. In RRBS, CpG sites are likely to be clustered locally within small genomic regions, so smoothing will still help to improve the methylation estimation.
https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/DSS/inst/doc/DSS.html#4_Frequently_Asked_Questions使用DSS進(jìn)行BS-seq差異甲基化分析
總覽 為了檢測(cè)差異甲基化，在每個(gè)CpG位點(diǎn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)測(cè)試，然后根據(jù)指定的閾值進(jìn)行差異甲基化位點(diǎn)（DML）或差異甲基化區(qū)域（DMR）分析。 嚴(yán)格的統(tǒng)計(jì)測(cè)試應(yīng)考慮重復(fù)樣本之間的生物...
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https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/CoxBoost/
CoxBoost
單純的COX模型可解釋性很強(qiáng)，但是預(yù)測(cè)性能不能滿足我的要求，所以采用花式優(yōu)化COX模型。想了兩種方法，一種是用Boosting，Bagging，方法二是提取主成分。然后今天搜...
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凌川美兮 ·
你好，請(qǐng)問cptac數(shù)據(jù)中樣本是根據(jù)什么區(qū)分的癌癥和正常的呢??
83a31eeb2e3b 評(píng)論自CPTAC蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)的使用 -
MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負(fù)了努力
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后會(huì)有期呀
暫別簡(jiǎn)書，后會(huì)有期
我不是老師，也不是大神，更不是前輩。我只是個(gè)普通的科研工作者，一個(gè)只想努力變得更好的人。 來到簡(jiǎn)書快3年了，期間寫了不少的筆記。很多的筆記是在疫情嚴(yán)重時(shí)wfh的時(shí)候?qū)懙?。至?..
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您好GSE80316數(shù)據(jù)集中的ID_REF是“2839538_st”這種，但是GPL17586中的probeset_id，和ID是TC01000001.hg.1完全不對(duì)應(yīng)
GPL17586、GPL19251和GPL16686平臺(tái)芯片ID轉(zhuǎn)換
原文載于生信技能樹我寫此文是為了致敬生信技能樹團(tuán)隊(duì)！感謝他們無私分享！ 以下是生信技能樹學(xué)員筆記投稿 芯片分析中經(jīng)常會(huì)遇到Affymetrix Human Transcrip...
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@Refrain_9738 是不是你的變量都有相關(guān)性啊
TCGA數(shù)據(jù)差異分析后生存分析（批量單因素cox回歸/Lasso篩選，多因素cox建模，時(shí)間依賴ROC曲線及KM plot可視化）
測(cè)序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測(cè)序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測(cè)序pipeline：從raw r...
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不需要分組信息么
用clusterProfiler做GSEA（二）
之前寫過用clusterProfiler做GSEA,enrichplot中的gseaplot作圖，但是圖沒有最新版enrichplot包的gseaplot2做的圖好看。此外，...
