1. GSE138709 5個(gè)腫瘤樣本 + 3個(gè)鄰近的正常組織 數(shù)據(jù)集鏈接:GEO Accession viewer (nih.gov)[https://www.ncbi.n...
1. GSE138709 5個(gè)腫瘤樣本 + 3個(gè)鄰近的正常組織 數(shù)據(jù)集鏈接:GEO Accession viewer (nih.gov)[https://www.ncbi.n...
基礎(chǔ)概念 腫瘤突變負(fù)荷(TMB) 是指特定基因組區(qū)域內(nèi)體細(xì)胞非同義突變的個(gè)數(shù),通常用每兆堿基多少個(gè)突變表示(mut/Mb),在早期研究中也直接以突變數(shù)量表示。 TMB 可以間...
前面給大家講解過(guò)新版的TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中,RNAseq的表達(dá)矩陣中加入了一列g(shù)ene type。 ?[https://link.zhihu.com/?target=https%...
1. 問(wèn)題描述 使用ggplot繪制柱狀圖時(shí),我們可能需要對(duì)柱進(jìn)行排序,例如,我們想探究看電視的平均時(shí)長(zhǎng)和宗教信仰之間的關(guān)系: 由于柱子排布沒(méi)有明顯規(guī)律,所以圖非常難解讀。因...
上一期給大家簡(jiǎn)單介紹了 ?[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/s%3F__biz%3DMzI4...
寫(xiě)在前面: 來(lái)自生信技能樹(shù)《生信必修課之軟件安裝》學(xué)會(huì)用包管理工具安裝軟件 普通安裝和配置,請(qǐng)看這篇Linux下bowtie2安裝(非conda)和配置 注意 現(xiàn)在清華鏡像源...
作者:JackTian文章首發(fā)于公眾號(hào):【杰哥的IT之旅】 大家好,我是杰哥。 在 Linux 環(huán)境下 top 命令都不陌生,它以實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)的方式查看系統(tǒng)的整體運(yùn)行情況,綜合了...
寫(xiě)作之友 基因和基因簇的功能譜 (functional profiles) 的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析及可視化 G Yu, LG Wang, Y Han, QY He. clusterPr...
做生物學(xué)研究的人,難免會(huì)遇到各種各樣的基因ID號(hào)。有我們比較熟悉的也比較直觀的基因名字,如TP53。也有其他數(shù)據(jù)庫(kù)里,但是也比較常用的ID,如ensembl ID,entre...