關(guān)于該軟件的計(jì)算可選參數(shù)以及結(jié)果文件的解讀，見前三篇分享： 序列比對(duì)軟件 MUMmer 快速上手（一）[http://www.itdecent.cn/writer#/not...
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序列比對(duì)軟件 MUMmer 結(jié)果可讀化處理（四）
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主成分分析-PCA圖的優(yōu)化（R語(yǔ)言）
R語(yǔ)言的主成分分析（PCA）詳解和帶聚類的PCA圖繪制 最近有個(gè)老師在整理文章數(shù)據(jù)，由于分組較多，想展示PCA圖，說明不同分組的差異，公司默認(rèn)給出的PCA圖比較樸素，想做的好...
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rehh：?jiǎn)伪扼w/單倍型群體間選擇信號(hào)分析（基于selective sweep）本文介紹的方法都是基于Extended Haplotype Homozygosity (EHH)概念，由SABETI 等人在 2002年提出。簡(jiǎn)單來說，根據(jù)selective...
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nextflow中文文檔（3）：Nextflow腳本（Nextflow scripting）
Nextflow scripting Nextflow腳本語(yǔ)言是Groovy編程語(yǔ)言的擴(kuò)展。Groovy是用于Java虛擬機(jī)的強(qiáng)大編程語(yǔ)言。Nextflow語(yǔ)法專門用于以聲明...
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生信-爬蟲 | 異步爬取網(wǎng)頁(yè)表格數(shù)據(jù)寫在前面 前段時(shí)間，師姐讓爬取一些LncRNA的一些信息，具體在下面的網(wǎng)站中：LncBook：https://ngdc.cncb.ac.cn/lncbook/lncrnas[...
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Docker封裝生物信息學(xué)甲基化流程
CpG CHG CHH含義p代表磷酸二酯鍵，CpG指的是甲基化的C的下游是1個(gè)G堿基。H代表除了G堿基之外的其他堿基，即A, C, T中的任意一種，CHG代表甲基化的C下游...
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Conda小事項(xiàng)
1. 更新conda $ conda update conda 2. 如果不希望在啟動(dòng)時(shí)激活conda的基本環(huán)境 set the auto_activate_base par...
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Orthofinder運(yùn)行結(jié)果文件解讀OrthoFinder結(jié)果文件 運(yùn)行標(biāo)準(zhǔn)OrthoFinder會(huì)產(chǎn)生一系列文件：直系同源組、直系同源、基因樹、物種樹、基因復(fù)制事件、比較基因組學(xué)數(shù)據(jù)。結(jié)果文件在所分析物種的....
