特別感謝賣(mài)萌哥[http://www.itdecent.cn/u/77fc519c6fa2]對(duì)于R gene的資源分享和指導(dǎo)幫助 參考文獻(xiàn)：RGAugury: a pipe...
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尋找R gene三種方法之RGAugury -
WGDI軟件（二）：?jiǎn)蝹€(gè)物種共線性點(diǎn)陣圖-dotplot前言 點(diǎn)陣圖（dotplot）作為比較基因組最基礎(chǔ)的分析，常用的分析軟件有JCVI、mummer等，這里介紹一種新的點(diǎn)陣圖方法，即WGDI畫(huà)點(diǎn)陣圖。軟件安裝見(jiàn)小編另一篇博客W...
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赤裸裸的統(tǒng)計(jì)學(xué)（九）：中心極限值定律
整體有標(biāo)準(zhǔn)差，平均數(shù)。 抽樣也有標(biāo)準(zhǔn)差，平均數(shù)。 抽樣的平均數(shù)分布在整體平均數(shù)的左右，呈正態(tài)分布，這個(gè)正態(tài)的?是標(biāo)準(zhǔn)誤。標(biāo)準(zhǔn)誤的計(jì)算公式為S/√n，S為群體...
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赤裸裸的統(tǒng)計(jì)學(xué)（五）:概率和期望值
概率可以幫我們?cè)谏钪羞M(jìn)行決策。比如我們應(yīng)該拒絕賭博，因?yàn)殡m然偶爾可以贏，但總體期望是小于付出的，而多次的重復(fù)行為會(huì)使結(jié)果收斂于期望值。 我們每次做選擇時(shí)是很...
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赤裸裸統(tǒng)計(jì)學(xué)（三）：統(tǒng)計(jì)數(shù)字會(huì)撒謊
原始數(shù)據(jù)是多維而混亂的，統(tǒng)計(jì)學(xué)的過(guò)程就是將混亂的數(shù)據(jù)提取精煉成可讀的數(shù)字。在LOL中我常常為其他人介紹自己喜歡的選手，比如uzi，但我不可能拿著uzi所有比賽錄像告訴他...
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python文本處理（一）：命令行傳參，讀取ini配置文件，format填充模板，fileinput構(gòu)建數(shù)據(jù)流
? 隨著我們python的深入，必然需要引用外界的參數(shù)。那么常見(jiàn)的都有哪幾種方式呢？ sys.argv----方便快捷argparse.ArgumentParser()---...
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生信常用數(shù)據(jù)庫(kù)（四）：NR數(shù)據(jù)庫(kù)分類(lèi)搭建前言 因?yàn)橥暾腘R數(shù)據(jù)庫(kù)下載下來(lái)后數(shù)據(jù)量非常龐大，在我們做序列比對(duì)的時(shí)候，尤其是很多很大的序列比對(duì)的時(shí)候，特別消耗計(jì)算資源和內(nèi)存，最重要的是很耽誤分析的周期，因此將NR...
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生信常用數(shù)據(jù)庫(kù)（一）：interproscan數(shù)據(jù)庫(kù)搭建
前言 Interproscan,通過(guò)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域和功能位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)功能。是EBI開(kāi)發(fā)的一個(gè)集成了蛋白質(zhì)家族、結(jié)構(gòu)域和功能位點(diǎn)的非冗余數(shù)據(jù)庫(kù)，該數(shù)據(jù)庫(kù)集成了一系列的數(shù)...
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NCBI數(shù)據(jù)下載工具：aspera的安裝與使用
前言 生物信息分析總是避不開(kāi)從NCBI上下載數(shù)據(jù)，但是很多時(shí)候通過(guò)瀏覽器登錄NCBI都費(fèi)勁，更別說(shuō)下載大量的數(shù)據(jù)了，所以很必要了解一下NCBI數(shù)據(jù)下載工具aspera，該...
