發(fā)簡(jiǎn)信
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樸素貝葉斯
????很多分類算法中，特征與標(biāo)簽之間的關(guān)系并非決定性的。算法得出的結(jié)論，永遠(yuǎn)不是100%確定對(duì)的，更多的是判斷出了一種“樣本的標(biāo)簽更可能是某類...
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邏輯回歸
邏輯回歸(logistic regression) 名為"回歸"的線性分類器，由線性回歸變化而來(lái)，一種廣泛使用于分類問題中的廣義回歸算法。 線性...
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muon來(lái)分析cite-seq數(shù)據(jù)
卡卡最近接觸到了cite-seq數(shù)據(jù)，需要對(duì)cite-seq的數(shù)據(jù)分析流程進(jìn)行搭建，因此調(diào)研了相關(guān)知識(shí)。 cite-seq CITE-seq技術(shù)...
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卡卡愛車之保養(yǎng)
卡卡有一輛便宜的代步車，之前比較懶，保養(yǎng)的時(shí)候工作人員說什么就是什么，后來(lái)發(fā)現(xiàn)不對(duì)，好像總是在被忽悠，所以想自己研究下保養(yǎng)手冊(cè)，做到心中有數(shù)。 ...
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基于剪切速率的擬時(shí)序分析單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序 (scRNA-seq)中擬時(shí)序分析是很常見的，是用來(lái)推斷不同的細(xì)胞類型間的發(fā)育關(guān)系，有一類通過RNA速率來(lái)推斷軌跡的方法，在此...
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運(yùn)動(dòng)為什么會(huì)快樂
久坐傷身，卡卡作為生信工程師，常常久坐，不舒服去醫(yī)院，醫(yī)生建議多運(yùn)動(dòng)，意外體會(huì)到了運(yùn)動(dòng)的樂趣，運(yùn)動(dòng)前百般不愿，但是運(yùn)動(dòng)完會(huì)感覺到前所未有的平靜，...
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10X Genomics Chromium VS Drop-seq
卡卡在單細(xì)胞方面也工作了很多年了，一般相關(guān)的問題都難不倒我。但是最近有人問我，10X單細(xì)胞技術(shù)和drop-seq技術(shù)的差異在哪？我竟然支支吾吾半...
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spaceranger知識(shí)(1)卡卡最近接觸到了單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù)，需要對(duì)其進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)分析得到統(tǒng)一的數(shù)據(jù)格式，接觸到了spaceranger軟件。 spaceranger軟件...
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Seurat知識(shí)點(diǎn)(2)
UMAP (Uniform Manifold Approximation and Projection) 降維也是seurat中常用的降維可視化...