前兩次教程“GEO數(shù)據(jù)挖掘（一）簡單快速下載GEO數(shù)據(jù)[http://www.itdecent.cn/p/88b5db10f00d]”、“GEO數(shù)據(jù)挖掘（一）下載SRA庫原...
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GEO數(shù)據(jù)挖掘（二）-- 基因差異表達分析及可視化全套代碼分享 -
GEO數(shù)據(jù)挖掘（一）--簡單快速下載GEO數(shù)據(jù)之前我們已經(jīng)和大家分享過如何上傳GEO數(shù)據(jù)[http://www.itdecent.cn/p/40d474378bbb]，同樣，我們也可以從公共數(shù)據(jù)庫下載其他研究者的數(shù)據(jù)進...
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篩選差異基因，倍數(shù)法，t檢驗，SAM一、 實驗內(nèi)容利用SAM篩選差異基因比較篩選差異基因的方法：倍數(shù)法，t檢驗，SAM二、 實驗?zāi)康?掌握篩選差異基因的方法，為了探究倍數(shù)法，t檢驗，SAM這三種篩選差異基因...
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差異分析R語言實現(xiàn)這次我來詳細的講講數(shù)據(jù)預(yù)處理，數(shù)據(jù)預(yù)處理這個過程呢，按我的理解就是先把高通量熒光信號轉(zhuǎn)化成基因表達數(shù)據(jù)，然后把各種各樣的的數(shù)據(jù)(有缺失值，有異常值，有值很小的，表達水平為負的...
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GEO數(shù)據(jù)挖掘之第一步：數(shù)據(jù)預(yù)處理與差異分析作為一個剛接觸生物信息這個專業(yè)小白，我正在努力學習著最基礎(chǔ)的東西，最先是了解GEO數(shù)據(jù)庫，自己利用數(shù)據(jù)進行分析，還好之前有R語言基礎(chǔ)，這第一步就花了很長時間，但是完成后是很有...
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可能會用到的R語言包~41 webshot 在 生信星球 公眾號看到的推文 聽說你的?；鶊D也無法保存？ 主要功能是可以把html文件保存為 png 或者 pdf 格式 2 pez 系統(tǒng)全面的系統(tǒng)發(fā)育...
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通過整理TCGA數(shù)據(jù)，探索某癌癥的癌組織和正常組織的差異基因。
實驗設(shè)計 實驗?zāi)康臎Q定試驗方法和途徑。試驗?zāi)康?:獲取三陰性乳腺癌的正常組織和癌癥組織的基因表達差異情況，比較三陰性乳腺癌中的基因表達變化情況。試驗設(shè)計 :通過TCGA獲取乳...
