前言 最近在看一些關(guān)于生態(tài)、遺傳、基因組進(jìn)化等的文獻(xiàn)，其中有個(gè)很多人用的也用了很久的用以判斷物種選擇壓力的數(shù)值，（Ka/Ks）。發(fā)現(xiàn)在國(guó)內(nèi)的資料中比較少，即使有，也只是教大家...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：山東
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用以判斷選擇壓力的Ka/Ks的計(jì)算 -
使用pyGenomeTracks繪制表觀展示圖pyGenomeTracks是什么 首先在介紹pyGenomeTracks之前， 先說幾個(gè)常用的表觀組學(xué)數(shù)據(jù)展示工具，IGV，UCSC和WashU。其中大家用的最多的應(yīng)該就是...
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三代變異檢測(cè)操作說明-DeepVariant
作者：Charon審稿：童蒙編輯：amethyst 眾所周知，三代測(cè)序的單堿基測(cè)序錯(cuò)誤率遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于二代測(cè)序，PB的單堿基錯(cuò)誤率有10-15%，而ONT也有5-20%[1]，那么...
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ABBA-BABA遺傳滲入分析（Dsuite軟件）ABBA-BABA分析方法最早發(fā)布于2012年NATURE的文章：Butterfly genome reveals promiscuous exchange of mimic...
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GenomeSyn基因組共線性及結(jié)構(gòu)變異可視化工具三代Pacbio和Nanopore測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展推動(dòng)了比較基因組學(xué)領(lǐng)域的進(jìn)步，泛基因組構(gòu)建和結(jié)構(gòu)變異識(shí)別成為該領(lǐng)域研究前沿。其中，共線性分析是比較基因組學(xué)的重要組成部分，...
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新的遺傳作圖工具PolyGemblerAssembly of whole-chromosome pseudomolecules for polyploid plant genomes using outbred ...
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【基因組注釋】ncRNA注釋1. ncRNA 非編碼RNA(Non-coding RNA, ncRNA) 包括rRNA，tRNA，snRNA，snoRNA 和microRNA 等不編碼蛋白質(zhì)的RNA，它...
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使用MAKER進(jìn)行注釋: 如何避免多輪MAKER時(shí)的重復(fù)運(yùn)算
通常而言，我們會(huì)運(yùn)行不只一輪的MAKER。如果參考組序列沒有變化，那么有一些計(jì)算只需要做一次就行了，例如將EST, Repeat和Protein序列比對(duì)到參考基因組，得到它們...
