前言 最近在看一些關于生態(tài)、遺傳、基因組進化等的文獻，其中有個很多人用的也用了很久的用以判斷物種選擇壓力的數(shù)值，（Ka/Ks）。發(fā)現(xiàn)在國內(nèi)的資料中比較少，即使有，也只是教大家...
發(fā)簡信
IP屬地：廣東
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用以判斷選擇壓力的Ka/Ks的計算 -
鳶尾花(iris)數(shù)據(jù)集分析??Iris 鳶尾花數(shù)據(jù)集是一個經(jīng)典數(shù)據(jù)集，在統(tǒng)計學習和機器學習領域都經(jīng)常被用作示例。數(shù)據(jù)集內(nèi)包含 3 類共 150 條記錄，每類各 50 個數(shù)據(jù)，每條記錄都有 4 項特征：...
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用Modules優(yōu)雅地管理你的環(huán)境變量
我管理的基因組學群里，今天有人提出了這樣一個問題，如果有多個版本的BLAST，并且都是用conda安裝，應該如何調用不同版本的BLAST 對于這個問題，其實存在多種解決方案：...
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應該是最新最詳細的MUMmer中文使用說明如何使用MUMmer比對大片段序列 測序技術剛開始發(fā)展的時候，大家得到的序列都是單個基因的長度，所以一般都是逐個基因的比較，用的都是BLAST或FASTA通過逐個基因聯(lián)配的方...
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我在簡書的第4周年
今天登陸簡書的時候看到了一個提示，提醒我已經(jīng)加入簡書4周年了。 不知不覺已經(jīng)寫了將近50多萬的字（不計代碼），也沒有想到原來我加入簡書正好是五四。 正如當我的粉絲數(shù)達到400...
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基于R語言繪制坐標軸截斷圖畫圖時經(jīng)常遇到不同組的數(shù)據(jù)大小相差很大，大數(shù)據(jù)就會掩蓋小數(shù)據(jù)的變化規(guī)律，這時候可以對Y軸進行截斷，從而可以在不同層面（大數(shù)據(jù)和小數(shù)據(jù)層面）全面反映數(shù)據(jù)變化情況，如下圖所示。 ...
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博客翻譯-seqkit代碼概述
文章翻譯自Seqtk: code walkthrough 在推特上，Zach charlop-powers請我寫寫seqkt的代碼介紹。這個博客就是簡單解釋下seqtk。 S...
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ChIP-seq基礎入門理解ChIP-Seq 到了目前這個水平，我學習新的高通量數(shù)據(jù)分析流程時已經(jīng)不再考慮代碼應該如何寫的問題了。我更多要去考慮一個技術的目的和意義。 轉錄組主要研究的問題是基因在不...
