目的 基因功能的注釋依賴于基因結(jié)構(gòu)或者序列，將基因序列或蛋白序列和主流數(shù)據(jù)庫進行比對獲取該基因的功能信息，最終對預(yù)測的編碼基因進行功能注釋，從而了解相關(guān)生物學(xué)意義。 做法 E...
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轉(zhuǎn)錄組分析(6) - 基因注釋 -
無參轉(zhuǎn)錄組序列組裝 — Trinity轉(zhuǎn)錄組分析策略 轉(zhuǎn)錄組分析策略根據(jù)有無參考轉(zhuǎn)錄組可以分為兩類： 有參比對—定量—差異分析—功能富集分析等 無參組裝—定量—差異分析—功能富集分析等image 無參考轉(zhuǎn)錄組序列...
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win7企業(yè)版激活方式
以管理員身份啟動cmd 輸入slmgr /skms kms.03k.org 輸入slmgr /ipk 33PXH-7Y6KF-2VJC9-XBBR8-HVTHH 輸入slmg...
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宏轉(zhuǎn)錄組分析：SortMeRNA鑒定過濾rRNA導(dǎo)讀 轉(zhuǎn)錄組測序一般期望得到的是mRNA的信息，但是總RNA當中絕大部分都是rRNA。rRNA的信息一般是無用的，所以需要去除總RNA中的rRNA，獲得較純的mRNA。真核生...
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一個植物轉(zhuǎn)錄組項目的實戰(zhàn)（轉(zhuǎn)載）其實這個植物是擬南芥，所以跟人類研究的數(shù)據(jù)處理大同小異。 轉(zhuǎn)錄組 轉(zhuǎn)錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有 RNA 的總和，包括 mRNA 和非編碼 ...
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RNA-seq(5):序列比對：Hisat2比對軟件很多，首先大家去收集一下，因為我們是帶大家入門，請統(tǒng)一用hisat2(官網(wǎng)https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/index.shtm...
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轉(zhuǎn)錄組入門（4）：了解參考基因組及基因注釋作業(yè)要求 在UCSC下載hg19參考基因組，群主博客有詳細說明，從gencode數(shù)據(jù)庫下載基因注釋文件，并且用IGV去查看你感興趣的基因的結(jié)構(gòu)，例如TP53，EGFR等等。截...
