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風中的魚兒

參考自知乎：https://zhuanlan.zhihu.com/p/20702684

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比對使用STAR 計算counts使用featureCounts 轉(zhuǎn)化counts使用腳本 readsToTPM.pl $usage = "perl feartureCoun...

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P-value 的計算方式 1) P-value 是 (在H0 = true的情況下)得到和試驗數(shù)據(jù)一樣極端(或更極端)的統(tǒng)計量的概率. 它不是H1發(fā)生的概率. 假定吃蘋果的...

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##Time:2017-10-8 ##Author:Feng Shengyu #-----------------------------------------------...

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nohup STAR --runThreadN 10 --runMode genomeGenerate --genomeDir ./ --genomeFastaFiles ....

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一、打開文件、保存、關(guān)閉文件(vi命令模式下使用) vi filename //打開filename文件 :w //保存文件 :w yusi123.com//保存...

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引自jimmy大神 雪晴

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sed -n '9p' filename #打印第9行 sed -n '9,19p' filename #打印第9-19行

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du -h （disk usage -human） 查看當前目錄下所有文件的大?。ㄟf歸查詢） -h 的意思是human，用人可以看懂的方式呈現(xiàn) du -sh 查看當前目錄中...

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目的：通過GO富集分析，可以將差異表的的基因按照其功能進行歸類，達到對基因進行注釋和分類的目的。 富集的原理：enrich_factor-----( 某個term中出現(xiàn)的差異...

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原理：WGCNA算法首先假定基因網(wǎng)絡服從無尺度分布，并定義基因共表達相關(guān)矩陣、基因網(wǎng)絡形成的鄰接函數(shù)，然后計算不同節(jié)點的相異系數(shù)，并據(jù)此構(gòu)建分層聚類樹(，該聚類樹的不同分支代...

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查看物理CPU的個數(shù) grep 'physical id' /proc/cpuinfo | sort -u 查看每個CPU上具有的核心數(shù)量 grep 'core id' /p...

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下載所有的以gtf為后綴的文件： wget -c -r -np -nd -k -L -A “*gtf.gz”ftp://ftp.sanger.ac.uk/pub/gencod...

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@EAS139:136:FC706VJ:2:2104:15343:197393 1:Y:18:ATCACG EAS139the unique instrument name ...

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似乎是名額終于定下來了~~~終于可以解放一下下了 到底要去哪？難道我真的就這樣放棄去北大，上交這種一流名校的機會，選擇最開始的同濟？到底是為什么？是什么吸引了我？我怕是中毒了...

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使用的數(shù)據(jù)，雙端測序數(shù)據(jù)clean data 1 &clean data 2 1、bowtie建庫 bowtie2-build genome.fa genome_index ...