參考自知乎:https://zhuanlan.zhihu.com/p/20702684
比對使用STAR 計算counts使用featureCounts 轉(zhuǎn)化counts使用腳本 readsToTPM.pl $usage = "perl feartureCoun...
P-value 的計算方式 1) P-value 是 (在H0 = true的情況下)得到和試驗數(shù)據(jù)一樣極端(或更極端)的統(tǒng)計量的概率. 它不是H1發(fā)生的概率. 假定吃蘋果的...
##Time:2017-10-8 ##Author:Feng Shengyu #-----------------------------------------------...
nohup STAR --runThreadN 10 --runMode genomeGenerate --genomeDir ./ --genomeFastaFiles ....
目的:通過GO富集分析,可以將差異表的的基因按照其功能進行歸類,達到對基因進行注釋和分類的目的。 富集的原理:enrich_factor-----( 某個term中出現(xiàn)的差異...
查看物理CPU的個數(shù) grep 'physical id' /proc/cpuinfo | sort -u 查看每個CPU上具有的核心數(shù)量 grep 'core id' /p...
使用的數(shù)據(jù),雙端測序數(shù)據(jù)clean data 1 &clean data 2 1、bowtie建庫 bowtie2-build genome.fa genome_index ...