總結(jié) 準(zhǔn)備工作： 設(shè)置工作目錄，用pymol去除水分子，分離蛋白和小分子，得到各自的pdb文件。 （如果是預(yù)測得到的蛋白pdb，那就直接拿來用咯，如果是已知結(jié)構(gòu)可從pdb數(shù)據(jù)...
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理解autodock分子對接思路和流程
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分子對接軟件-vina1，簡介 Vina由美國 The Scripps Research Institute的Dr. Oleg Trott設(shè)計創(chuàng)立，全稱為AutoDock Vina。網(wǎng)站：http...
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Autodock分子對接完結(jié)&總結(jié)1.Grid （1） 打開蛋白，“Grid->Macromocule->Open”，打開“r.pdbqt”。彈出的對話框，點擊Yes及確定 （2） 打開小分子，“Grid->...
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2020-02-08 根據(jù)DAVID結(jié)果做圖GOterm分析
##根據(jù)DAVID結(jié)果做圖GOterm分析，數(shù)據(jù)格式從DAVID中下載，先保存至txt,后用excel打開，再保存為CSV格式 x<-read.csv(file = "C:\...
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DAVID數(shù)據(jù)制作KEGG的氣泡圖和柱狀圖DAVID數(shù)據(jù)制作KEGG的氣泡圖和柱狀圖 rm(list=ls()) library(ggplot2) library(Cairo) setwd("C:\\Users\\w...
