發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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細(xì)菌全基因組測(cè)序數(shù)據(jù)構(gòu)建SNP系統(tǒng)發(fā)育樹
本次分析使用到的數(shù)據(jù)及數(shù)據(jù)處理流程參考文獻(xiàn)“https://doi.org/10.1186/s13756-018-0352-y[https://...
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【宏基因組入門教程】（一）
最近接手了宏基因項(xiàng)目，會(huì)在之后接著發(fā)一系列的宏基因組入門教程，學(xué)習(xí)資料大概來自國(guó)外的教程。感謝Harriet Alexander, Phil B...
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"Perl lib version vXX doesn't match executable version vXX" 問題解決
裝idba的時(shí)候遇到一個(gè)小問題，執(zhí)行“./build.sh”總是會(huì)報(bào)錯(cuò)：/usr/bin/aclocal: Perl lib version (...
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細(xì)菌基因組下載
最近需要盡可能的下載細(xì)菌基因組，ncbi ftp站點(diǎn)（ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes）里面"all"這個(gè)目...
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生物信息python 入門題 初級(jí)至進(jìn)階
本文水平有點(diǎn)low，本來不打算寫這么低水平的文章，怎奈我的python水平就在這么low的水平。以此貼記錄初試python解決生信簡(jiǎn)單問題的學(xué)習(xí)...
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基因組組裝結(jié)果中去除細(xì)胞器序列
如果沒有該基因組細(xì)胞器序列，需要先組裝細(xì)胞器序列，再比對(duì)去除 如果有了該基因組的細(xì)胞器基因組（如公開數(shù)據(jù)庫(kù)可獲?。ㄟ^比對(duì)去除 細(xì)胞器基因組組...
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wtdbg 組裝基因組
關(guān)鍵詞：pacbio; nanopore; assemble wtdbg相較于其他三代四代數(shù)據(jù)組裝軟件（Canu，smartdenovo，min...
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nanopore數(shù)據(jù)組裝人類基因組Sergey Koren和Adam Phillippy提出了一種“trio binning”組裝策略組裝人的基因組單倍型。兩位大神參與了多個(gè)組裝...