比較基因組學(xué)之共線性工具JCVI安裝及使用 jcvi及依賴的安裝 $ conda create -n jcvi -c bioconda -c c...
寫在前面 不知道怎么回事,上一篇推文寫完發(fā)布后少了一大段所以這部分是上一篇未顯示的部分 但也有研究者認(rèn)為在存在種群結(jié)構(gòu)的情況下,個(gè)體樣本中性狀的...
文獻(xiàn)地址:next-generation genetics in plant[https://www.nature.com/articles/n...
注:本次使用的數(shù)據(jù)為不同品種李子重測(cè)序 1.準(zhǔn)備工作 首先下載相應(yīng)的參考基因組及注釋文件{本次使用的參考基因組為三月李的,參考基因組從薔薇科植物...
全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)實(shí)操 數(shù)據(jù)及代碼來源:GWAS_in_R[https://github.com/whussain2/R-for-Pl...
使用GATK進(jìn)行全基因組數(shù)據(jù)分析后獲得vcf文件,對(duì)不同品種變異數(shù)據(jù)進(jìn)行特異共有變異位點(diǎn)數(shù)據(jù)提取 使用工具 BCFtools bcftools的...
HMMER3.3的安裝 瀏覽器搜索hmmer進(jìn)入hmmer官網(wǎng)選擇相應(yīng)版本復(fù)制下載鏈接 wget http://eddylab.org/soft...
撿書的垃圾,一個(gè)垃圾碩士的自詡,從今開始記錄每一天的生活狀態(tài)及學(xué)習(xí)生物技術(shù)和生信分析所遇見的問題