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CFDI｜藥物臨床試驗中不良事件的案例收集與評判
小編旁白CFDI核查老師強力發(fā)文，對藥物臨床試驗中AE的相關問題從4大方面詳細總結：···AE的定義、收集、分級及其與試驗用藥品的相關性···AE的處理、記錄、隨訪和報告··...
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【原創(chuàng)干貨】一文搞清楚病例對照研究和隊列研究！如果你是初到臨床，首先接觸到的可能不是脫離本科藍色生死戀的快感，而是無限循環(huán)每天早上的查房交班，開藥，治療等等。 除此之外，你的老板還可能某天說：“誒，小王，來臨床這么久了，...
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分享各種各樣的科研日常。
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表達譜分析組織中細胞組分情況 --- CIBERSORT & xCell腫瘤微環(huán)境是近年來的研究熱點。復雜而動態(tài)的微環(huán)境中，腫瘤細胞與浸潤性免疫細胞、基質細胞等相互作用，這在促進或抑制腫瘤生長、侵襲、轉移以及對病人臨床預后方面可能具有多方面的影響...
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NetworkAnalyst3.0：差異基因篩選，功能富集分析、基因網絡構建等功能于一體的在線基因表達分析工具
hello大家好，小月亮又和大家見面了。上篇軟文小月亮給大家介紹了NetworkAnalyst3.0工具的概覽。這次小月亮就給大家詳細介紹NetworkAnalyst3.0工...
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對于多表型數(shù)據如何利用limma包進行差異基因分析
寫在前面最近在做GSVA，做到我有點自閉，不是因為這個算法有多難，而是他所耗費的時間有點夸張。加上校園網這兩天時不時“調皮”一下，做了兩次，等了四天，最后都白白浪費了。其實后...
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從差異基因中確定靶標 - 過表達
從差異基因中確定靶標 - 過表達 目前轉錄組測序實驗，已經是非常常用的技術。幾乎成為尋找差異分子（如mRNA/lncRNA/circRNA/miRNA）最重要的手段，同時該實...
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【生信技能樹】2020-01-08作業(yè)：GEO挖掘標準流程分析GSE27447題目出自【生信技能樹】公眾號文章：2011年的表達芯片分析和2019年的區(qū)別要求：走GEO標準分析流程分析GSE27447 代碼主要復制于Jimmy大佬的github：htt...
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GEO在學習-代碼GEO再學習 GEO數(shù)據挖掘已經成為生信學者必備技能,我以為自己會跑代碼了就是會了,其實呢,細細去領會每個細節(jié),還是會發(fā)現(xiàn)很多盲區(qū).聽了曉娟老師的課,發(fā)現(xiàn)很多很多細節(jié)我并不甚...
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R語言Cibersort文件獲取+代碼在R語言中運行Cibersort共需要三個文件，分別是（1）官方提供的22種細胞基因集“LM22.txt”；（2）自己的表達矩陣；（3）Cibersort代碼。 （1）LM2...
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折騰了許久才復現(xiàn)出的WGCNA圖-GSE106292你值得擁有
前些天老大布置了WGCNA的作業(yè)：下載GSE106292 數(shù)據集的 Excel表格如何讀入R里面，做出作者文章中那樣的圖，但是分組很復雜，需要去文章中找細節(jié)內容，老大jimm...
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套路分享：利用TCGA數(shù)據庫進行免疫細胞浸潤相關生信數(shù)據挖掘本文作者毛細血管，研究方向腫瘤學，目前主要在學習生信數(shù)據挖掘和腫瘤免疫微環(huán)境等，在后面的分享過程中主要分享自己學到的生信方面操作以及腫瘤免疫微環(huán)境相關的文獻解讀，現(xiàn)已發(fā)表me...
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