兜兜轉(zhuǎn)轉(zhuǎn),三年的折騰,終究是要畫上一個(gè)句話。兩地飛行,讓我硬生生成了“尊貴”的vip。一十四年,兩個(gè)七年。我們熬過了第一個(gè),熬不過第二個(gè)。我本來就不是一個(gè)喜歡有變化的人。甚至...
兜兜轉(zhuǎn)轉(zhuǎn),三年的折騰,終究是要畫上一個(gè)句話。兩地飛行,讓我硬生生成了“尊貴”的vip。一十四年,兩個(gè)七年。我們熬過了第一個(gè),熬不過第二個(gè)。我本來就不是一個(gè)喜歡有變化的人。甚至...
如果一個(gè)物種在進(jìn)化過程中發(fā)生了多倍體化,那么,在基因組上就會(huì)存在一些共線性區(qū)域(即兩個(gè)區(qū)域之間的基因是旁系同源基因,其基因的排布順序基本一致)。多倍化以及后續(xù)的基因丟失和二倍...
前言 近期,張澤民教授團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種在cell cluster里面計(jì)算純度的算法ROGUE,什么意思呢?經(jīng)過傳統(tǒng)的降維方式(t-SNE,UMAP)降維聚類后的cell clu...
單因素差異分析 對(duì)于DESeq來說,常用的單因素的差異分析已經(jīng)比較多了, 一般來說,對(duì)于基因的表達(dá)矩陣,放在前面的為對(duì)照組,后面的為處理組,所以結(jié)果為后面的比較前面的并且對(duì)于...
1.GO富集 使用orgDb 通過使用Bioconductor的AnnotationHub在線檢索并抓取OrgDb。非模式基因GO富集分析:以玉米為例+使用OrgDb[htt...
今天看到Plant physiology在線發(fā)表了一篇文章。 In this study, we developed a software package, named Gr...
在對(duì)動(dòng)植物雜交種(或F1子代)的基因組和轉(zhuǎn)錄組的關(guān)聯(lián)研究中,要回答這么一個(gè)問題:基因組變異到底與基因表達(dá)有什么關(guān)系? 這個(gè)問題很難,因?yàn)樯婕坝绊懟虮磉_(dá)調(diào)控的因素可太多了!多...
我不是老師,也不是大神,更不是前輩。我只是個(gè)普通的科研工作者,一個(gè)只想努力變得更好的人。 來到簡書快3年了,期間寫了不少的筆記。很多的筆記是在疫情嚴(yán)重時(shí)wfh的時(shí)候?qū)懙摹V两?..
寫在前面 近期輔助課題組成員做一些上游數(shù)據(jù)分析,于是跑了前面搭建的流程并準(zhǔn)備了系列分析結(jié)果文件,大體如下: 在其中「差異表達(dá)分析」的文件夾中,有系列文件,包括 KEGG Pa...