相信很多專題應(yīng)該已經(jīng)講過SCENIC的使用，這兒，針對我自己對SCENIC的學習使用，遇到的問題做一個詳細的講解說明，希望能對大家理解學習應(yīng)用SCENIC起到一些幫助。 SC...
發(fā)簡信
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單細胞轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析工具（TF，motifs）-SCENIC -
2019-08-28第七天：關(guān)于SCENIC的使用教程
文章來源：scenic: single-cell regulatory network inference and clustering github 一、軟件安裝 安裝教程...
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seurat-ScaleData()源碼解析一、ScaleData()簡介 單細胞基因表達counts矩陣數(shù)據(jù)經(jīng)過NormalizeData()歸一化處理后，還需要進行scale標準化。ScaleData()[http...
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文獻學習027--[sc]組織環(huán)境對中性粒細胞命運的共同決定作用最近對中性粒細胞感興趣，就多讀了幾篇文章。分享的這一篇是20年的cell。 HighlightsNeutrophils have variable lifetimes in ...
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文獻學習018--[sc]單細胞測序鑒定出特殊炎性巨噬細胞亞群可作為減輕急性腎臟損傷的治療靶點今年剛發(fā)在Advanced Science上的文章，影響因子16.806。 1. Mononuclear Phagocyte Atlas at Single-Cell Res...
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Seurat::DoHeatmap 的謎之報錯Seurat::DoHeatmap 的謎之報錯 最近在學習Seurat教程（Seurat版本3.0.2），發(fā)現(xiàn)運行到倒數(shù)第二步做熱圖展示marker genes時總是報錯 主...
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2021-06-23 3-5分 不需要實驗的生信期刊（中科院預(yù)警的已經(jīng)排除）
大多數(shù)人應(yīng)該不是中科院預(yù)警就行，部分期刊可能是吉大一院預(yù)警。 bmc cancer, Cancer Medicine, Frontiers in Genetics, INTE...
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基因ID轉(zhuǎn)換方法總結(jié)1. clusterProfiler包，bitr()轉(zhuǎn)換ID函數(shù) clusterProfiler 是Y叔寫的一個功能強大的R包，可以用來做各種富集分析，如GO、KEGG、DO...
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meta分析/系統(tǒng)評價中單臂研究的偏倚風險評價單臂研究（single arm study）：即單組臨床試驗，顧名思義，就是僅有一個組的研究，沒有為試驗組設(shè)計相對應(yīng)的對照。部分文章取名為病例系列研究（case series...
