發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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1.8featureCountshtseq實(shí)在太慢了，嘗試一下featureCounts1.下載安裝https://sourceforge.net/projects/subre...
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1.5構(gòu)建支原體index并比對(duì)blast確定轉(zhuǎn)錄組污染為Mycoplasma yeatsii GM274B1.尋找基因組https://www.ncbi.nlm.nih.go...
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1.4hisat2相關(guān)語(yǔ)句理解下列語(yǔ)句 活學(xué)活用 關(guān)于for語(yǔ)句的一點(diǎn)小問(wèn)題 加上想要循環(huán)計(jì)算某一串?dāng)?shù)字+2 如果加上引號(hào)，就是字符類型而不是numeric了 參考文獻(xiàn) ...
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1.3質(zhì)控結(jié)果解讀以最差的一個(gè)為例 總覽 綠色勾勾：合格的黃色嘆號(hào)：觸到了警戒線紅色叉叉：不合格 1.基礎(chǔ)數(shù)據(jù) reads長(zhǎng)度=150GC含量=47%reads數(shù)...
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1轉(zhuǎn)錄組fastq文件處理第一次轉(zhuǎn)錄組分析公司提供的數(shù)據(jù)為雙端fastq.gz，省略了sra轉(zhuǎn)換這步，sra轉(zhuǎn)換為fastq這步可以以后再說(shuō)了 數(shù)據(jù)校驗(yàn) 公司的測(cè)序文件提...
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1.2fastqc相關(guān)語(yǔ)句（理解find和ls的聯(lián)合使用）
理解下列語(yǔ)句 活學(xué)活用，尋找目錄下所有md5文件并進(jìn)行QC tips win掛載在mnt的共享文件，在linux中無(wú)法增加軟連接（Operati...
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1.1md5校驗(yàn)相關(guān)語(yǔ)句（理解find和xargs）
理解下列語(yǔ)句 活學(xué)活用，尋找目錄下所有md5文件并進(jìn)行校驗(yàn) 參考文獻(xiàn) linux find grep組合使用linux之find命令詳解Linu...
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0.2安裝轉(zhuǎn)錄組相關(guān)軟件
先更新python版本 參考：Ubuntu16.04系統(tǒng)查看已安裝的python版本，及其配置 python --version #查看當(dāng)前版本...
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0.1更新ubuntu早期版本至最新版本
在vm上安裝的ubuntu版本17.04默認(rèn)不再支持更新 換成國(guó)內(nèi)的源顯示無(wú)法連接，通過(guò)修改sources.list中為 old-release...