引言 在2023年4月6日，Nature Genetics發(fā)表了一篇題目為“Super-pangenome analyses highlight genomic divers...
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IP屬地：江蘇
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Nature Genetic | 番茄超級泛基因組的多樣性和結(jié)構(gòu)變異 -
任何人！十分鐘掌握Circos圖繪制
寫在寫在前面的前面 我不喜歡調(diào)用外部程序，如果是簡單的事情。我覺得應(yīng)該用最簡單的方式來實現(xiàn)。如果你只是想畫一個簡單的Circos圖，perl？不用的。R？不用的。網(wǎng)頁？不用的...
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Python3 提取CDS根據(jù)物種基因組和注釋文件，可以編寫腳本，提取特殊的序列結(jié)構(gòu)，完成個性化的分析。本文利用Python3提取擬南芥的最長編碼序列，并轉(zhuǎn)化為氨基酸序列輸出到文件中。 基因結(jié)構(gòu) 參考...
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Trim Galore ——自動檢測adapter的質(zhì)控軟件之前分析過的測序數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)質(zhì)量都很好，給了我一個錯覺質(zhì)控的前后差別不是很大，內(nèi)心里對質(zhì)控這一步也就不是很重視，跑完質(zhì)控有時也懶得看結(jié)果，拿到一批測序數(shù)據(jù)后，也總是忽略了去看測...
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Perl 命令行實戰(zhàn)2 - fastq文件的相關(guān)操作Perl 命令行實戰(zhàn)2 - fastq文件的相關(guān)操作 注：部分代碼可能不太實用，但是可以用來作為perl的單行程序的練習(xí)。 本文會不斷更新... 目錄 fastq文件的介紹前...
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BUSCO - 組裝質(zhì)量評估BUSCO - 組裝質(zhì)量評估軟件 BUSCO - Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs 額。直譯的話就是普遍通用的單拷貝直...
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2018-08-20 Metagenome分析教程
前言 之前看panda姐的blog時，發(fā)現(xiàn)介紹了篇關(guān)于Metagenome的分析教程，剛好就想著試著翻譯下，作為我的第一篇文章，順帶練練我MarkDown語法的訓(xùn)煉吧。 In...
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python OS 簡單操作命令
OS模塊-操作系統(tǒng)（Operating System) python中的OS模塊可以操作操作系統(tǒng),與操作系統(tǒng)交互.目前只要用來獲得文件夾或文件的路徑.此外還用來處理文件和目錄...
