什么是XMP XMP是內(nèi)存自帶的一種優(yōu)化技術(shù)，可以讓內(nèi)存頻率超頻運(yùn)行，從而提高計(jì)算效率。這項(xiàng)技術(shù)最初由intel推出，也就是我們說(shuō)的 Extreme Memory Profi...
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計(jì)算機(jī)配置XMP（DOCP） -
單細(xì)胞分析實(shí)錄(15): 基于monocle2的擬時(shí)序分析關(guān)于什么是“擬時(shí)序分析”，可以參考本期推送的另一篇推文。這一篇直接演示代碼 monocle2這個(gè)軟件用得太多了，很多文章都是monocle2的圖。因?yàn)橹皇褂帽磉_(dá)矩陣作為輸入，...
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單細(xì)胞軌跡分析
擬時(shí)間分析比較 http://genome.annoroad.com/News/Industry/1061.html https://mp.weixin.qq.com/s?_...
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scVelo計(jì)算RNA速率
一.導(dǎo)入需要的文件 需要的文件：由R里面對(duì)Seurat對(duì)象的數(shù)據(jù)導(dǎo)出的1.velocyto pipeline 跑出來(lái)的loom文件2.細(xì)胞名字文件3.細(xì)胞屬于的類(lèi)群4.細(xì)胞坐...
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【文獻(xiàn)解讀】綜述-單細(xì)胞數(shù)據(jù)做跨物種比較
單細(xì)胞RNA-seq測(cè)序技術(shù)對(duì)數(shù)百萬(wàn)個(gè)單細(xì)胞進(jìn)行定位的能力徹底改變了細(xì)胞核發(fā)育生物學(xué)領(lǐng)域，提供了極好的視角去理解在多物種中細(xì)胞類(lèi)型及功能的多樣性，這些技術(shù)有希望發(fā)展成為詳細(xì)描...
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WGCNA 挑選軟閾值我們今天就搞清楚這兩個(gè)問(wèn)題：1.什么是無(wú)尺度分布2.手工計(jì)算軟閾值 無(wú)尺度分布 假如我問(wèn)大家，如果你想認(rèn)識(shí)世界上的任何一個(gè)人，需要通過(guò)幾個(gè)人來(lái)聯(lián)系？ 6個(gè)。 這個(gè)就是6度分隔...
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單細(xì)胞測(cè)序（scRNA-seq）通關(guān)||數(shù)據(jù)處理必知必會(huì)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系列教程 sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jians...
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生信小白，掙扎在入門(mén)的路上，希望在簡(jiǎn)書(shū)上記錄學(xué)習(xí)的點(diǎn)滴，與大家一起交流學(xué)習(xí)。