原本以為畢業(yè)了就起飛了，沒(méi)想到，喵的比沒(méi)畢業(yè)還累...又鴿了仨月，這個(gè)小插件到時(shí)完善了不少，但是上次承諾的視頻還是沒(méi)有錄。原因不說(shuō)了，準(zhǔn)備手打！ 還是寫(xiě)個(gè)教程為好。錄視頻，怕...
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「TBtools plugin」WGCNA shiny 使用說(shuō)明 -
2022《Horticulture Research》| 泛轉(zhuǎn)錄組+GWAS/eQTL解析茶樹(shù)次級(jí)代謝物調(diào)控網(wǎng)絡(luò)2022年7月，劉仁義團(tuán)隊(duì)（福建農(nóng)林大學(xué)）和張興坦團(tuán)隊(duì)（福建農(nóng)林大學(xué)/中國(guó)農(nóng)科院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所）在Horticulture Research期刊（IF=7.291）發(fā)表...
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R語(yǔ)言~高級(jí)PCA分析主成分分析，不只需要找到幾個(gè)虛擬但不知具體為何物的主成分因子，還需要知道我們提供的變量在各個(gè)主成分因子上的載荷（有正有負(fù)）和貢獻(xiàn)度，以及具體保留多少個(gè)主成分因子才能既盡量保留...
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dRep物種集去冗余
drep可對(duì)基因組集去冗余，留下非冗余基因組集。從運(yùn)行過(guò)程來(lái)看，先進(jìn)行基因預(yù)測(cè)，然后用chekm做基因組質(zhì)控，也因此需要安裝配置checkm，去冗余基于ANI有關(guān)的參數(shù)。 文...
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「用一個(gè)更復(fù)雜的例子，來(lái)深入學(xué)習(xí)DESeq2差異表達(dá)分析后的小分析」這篇文章，對(duì)Griffith Lab[https://genviz.org/module-04-expression/0004/02/01/DifferentialExpre...
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FastAPI for Fun本文主要針對(duì)使用FastAPI構(gòu)建App可能用到的知識(shí)點(diǎn)做一個(gè)歸納總結(jié)，讓我們從一個(gè)簡(jiǎn)單的Hello world開(kāi)始吧。 Hello world 直接運(yùn)行上面的代碼或者命令行...
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WGCNA原理簡(jiǎn)介網(wǎng)絡(luò)圖 在傳統(tǒng)的網(wǎng)絡(luò)圖里面，一般分為非權(quán)重網(wǎng)絡(luò)和權(quán)重網(wǎng)絡(luò)對(duì)于非權(quán)重網(wǎng)絡(luò)： 非權(quán)重網(wǎng)絡(luò)的特點(diǎn)是只能表示兩個(gè)點(diǎn)之間是否有關(guān)系，單純的“一刀切”，即只有“有關(guān)系”和“無(wú)關(guān)系”這兩種...
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【哈佛大學(xué)：計(jì)算生物學(xué) & 生物信息學(xué)】學(xué)習(xí)記錄（三）局部比對(duì)算法 —— Smith-Waterman Algorithm Swimt-Waterman算法本質(zhì)上是一種Dynamic Programming（動(dòng)態(tài)規(guī)劃算法），和N...
