一、安裝軟件 1、HISAT2 將reads比對到基因組上 2、StringTie 將比對好的reads進(jìn)行拼裝并預(yù)計表達(dá)水平 3、SAM tools 課上已經(jīng)用sudo a...
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RNA-seq用hisat2、stringtie、DESeq2分析 -
ANNOVAR注釋水稻基因組
軟件： 1gffread conda install -c bioconda gffread gffread NIP-T2T.gff3 -T -o nip_t2t.gtf 2...
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BSA分析：GATK4的使用(包括bwa)
注意：版本不同，命令會不一致。一定要用對應(yīng)的版本。 需要登錄google賬戶 GATK3的下載地址[https://console.cloud.google.com/stor...
