CIBERSORT的注意事項(xiàng) CIBERSORT的使用,我們舉了幾個(gè)例子,但是還有一些疑問(wèn),只要有疑問(wèn)在,就感覺(jué)心里不踏實(shí)。比如:1.CIBERSORT需要什么樣的數(shù)據(jù)?是芯...
CIBERSORT的注意事項(xiàng) CIBERSORT的使用,我們舉了幾個(gè)例子,但是還有一些疑問(wèn),只要有疑問(wèn)在,就感覺(jué)心里不踏實(shí)。比如:1.CIBERSORT需要什么樣的數(shù)據(jù)?是芯...
對(duì)于sam文件格式,已經(jīng)有很多人寫過(guò)相應(yīng)的中文介紹文章,但是基本上都是簡(jiǎn)單粗暴的講了一下每個(gè)字符代表什么,但是如果真去研究的話有時(shí)候還是感覺(jué)有點(diǎn)這些寫的還是讓人懵逼,比如不知...
title: GDAS002-Bioconductor備忘錄date: 2019-09-02 12:0:00type: "tags"tags: Bioconductorcat...
NMF算法簡(jiǎn)介 非負(fù)矩陣分解(Non-negative Matrix Factorization, NMF)的思想可以描述為,對(duì)于任意給定的一個(gè)非負(fù)矩陣V,NMF算法能夠找到...
一、scMetabolism的安裝 scMetabolism是一個(gè)R包,用于在單細(xì)胞分辨率下量化代謝活性,目前只適用于物種是人的單細(xì)胞數(shù)據(jù)。作者推薦使用seurat的數(shù)據(jù)進(jìn)行...
上一步驟(第6篇:重復(fù)樣本的處理——IDR)用IDR對(duì)重復(fù)樣本peaks的一致性進(jìn)行了評(píng)估,同時(shí)得到了merge后的一致性的peaks——sample-idr,接下來(lái)就是對(duì)p...
1 關(guān)鍵細(xì)胞類型或Marker縮寫: 骨髓多能造血干細(xì)胞 HSC 淋巴樣祖細(xì)胞 lymphoid progenitor cell T細(xì)胞抗原識(shí)別受體 TCR 抗原提呈細(xì)胞 A...
R是一個(gè)在科研領(lǐng)域很常用的工具,經(jīng)常用R的年輕人或者經(jīng)常上統(tǒng)計(jì)之都的肯定知道Rstudio的存在。然而對(duì)于R和Rstudio來(lái)講,還是有很多問(wèn)題存在的,今天我就結(jié)合我上一次在...