0.僅作筆記使用 我所用到的所有腳本可以+Q 840842906索 簡(jiǎn)單介紹一下方向也可以，說(shuō)不定以后能互相幫忙～ 1. 這個(gè)工具有在線網(wǎng)頁(yè)版，當(dāng)然KEGG注釋還有其他很多工...
IP屬地：河南
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宏基因組 - (3)使用KofamKOALA對(duì)非冗余基因集進(jìn)行KEGG注釋 -
@1c43f522e1c3 biopython沒(méi)用過(guò)，知道bio系列的很多操作都封裝好了
python重命名fasta序列
fasta文件的序列名很亂怎么辦，自然是python重命名它嘍。 這里只展示兩種命名方式，一種是在“>”后面插入想要的字符串，后面的內(nèi)容不變;另一種是按照升序的方式，結(jié)合給的...
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一個(gè)表白程序的編譯與打包七夕就要到了，特意在github上搜了搜表白程序，發(fā)現(xiàn)了個(gè)CPP(C艸)寫的程序，基于Qt widget (cpp)的一個(gè)表白動(dòng)畫程序。鏈接為https://hub.fast...
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阿里云盤大文件及壓縮文件分享---以7645.45 MB的SGB.Jan19為例
以PhyloPhlAn 3.0使用的7645.45 MB的SGB.Jan19數(shù)據(jù)庫(kù)上傳到阿里云盤并分享為例。 眾所周知，目前阿里云盤上傳和下載都不限速，空間也比較大，很適合儲(chǔ)...
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通路是的，map和ko一樣，不過(guò)7. Drug Development這個(gè)有map沒(méi)有ko，筆記還有要改的地方
kegg pathway解析并對(duì)應(yīng)map號(hào)和ko號(hào)
昨天kegg pathway解析[http://www.itdecent.cn/p/beb0c3727a15]不是說(shuō)后面補(bǔ)上map號(hào)和ko號(hào)的對(duì)應(yīng)關(guān)系嗎，今天補(bǔ)上。 昨天的...
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使用Julia給出兩點(diǎn)經(jīng)緯度直接計(jì)算距離給出兩點(diǎn)之間的經(jīng)緯度，計(jì)算兩點(diǎn)之間的距離，使用如下公式：三角函數(shù)不必說(shuō)了，Lat12是兩點(diǎn)的緯度差，Lon是兩點(diǎn)的經(jīng)度差，Lat1和Lat2分別是兩點(diǎn)的緯度，6378.137...
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kegg pathway解析并對(duì)應(yīng)map號(hào)和ko號(hào)
昨天kegg pathway解析[http://www.itdecent.cn/p/beb0c3727a15]不是說(shuō)后面補(bǔ)上map號(hào)和ko號(hào)的對(duì)應(yīng)關(guān)系嗎，今天補(bǔ)上。 昨天的...
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kegg pathway解析kegg pathway解析之前寫過(guò)，鏈接在此:kegg pathway三級(jí)層級(jí)結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)對(duì)應(yīng)表格[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU3MzE...
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prokka注釋tsv文件統(tǒng)計(jì)
Prokka: rapid prokaryotic genome annotation .tsvTab-separated file of all features: loc...
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awk也很棒，能給出例子嗎，awk知道一點(diǎn)
python重命名fasta序列
fasta文件的序列名很亂怎么辦，自然是python重命名它嘍。 這里只展示兩種命名方式，一種是在“>”后面插入想要的字符串，后面的內(nèi)容不變;另一種是按照升序的方式，結(jié)合給的...
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Rserver源碼安裝我又從源碼安裝Rstudio-server了，前面安裝的幾次都是在手機(jī)上安裝的，均以失敗告終，這次不一樣，在電腦上安裝的，成功了，特此記錄成就。 為啥要從源碼安裝呢？原因有三...
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python重命名fasta序列
fasta文件的序列名很亂怎么辦，自然是python重命名它嘍。 這里只展示兩種命名方式，一種是在“>”后面插入想要的字符串，后面的內(nèi)容不變;另一種是按照升序的方式，結(jié)合給的...
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KO豐度轉(zhuǎn)換為pathway豐度經(jīng)常會(huì)遇到已經(jīng)有KO-number(代表基因家族信息)在各樣品中的豐度，如何轉(zhuǎn)換為level3等級(jí)的KEGG pathway(通路)豐度表呢？ 目標(biāo)如下： 轉(zhuǎn)換為 首先你要通...
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ggplot2時(shí)間序列圖
廢話不多說(shuō)，先看圖 然后是代碼部分 沒(méi)有注釋，看不懂的就去學(xué)習(xí)吧。如果沒(méi)有simkai.ttf這個(gè)字體會(huì)報(bào)錯(cuò)。需要選擇你電腦上有的中文字體。 對(duì)了，數(shù)據(jù)是這樣的
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WSL Ubuntu 18.04安裝R 4.0及tidyverse并解決xml2的安裝問(wèn)題
首先說(shuō)說(shuō)為什么要寫這篇文章，原因有二：其一，WSL Ubuntu 18.04默認(rèn)的R為3.4版本有點(diǎn)舊，想用最新版4.0+的；其二，之前切換過(guò)ubuntu 18.04的R版本...
