什么是組間差異檢驗(yàn)？就是組間的差異分析以及顯著性檢驗(yàn)，應(yīng)用統(tǒng)計(jì)學(xué)上的假設(shè)檢驗(yàn)方法，檢驗(yàn)組間是否有差異及其差異程度。坦率地講，所有的差異檢驗(yàn)都基于一個(gè)假設(shè)：組間沒有差異，變量之...
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組間差異檢驗(yàn)，終于有人講清楚了! -
Ubuntu20安裝流程與R語言環(huán)境配備
安裝Ubantu桌面版 服務(wù)器版無自帶瀏覽器，由于特殊需求故裝了桌面版，內(nèi)核一樣，但需要額外的配置才能做服務(wù)器下載鏡像：https://cn.ubuntu.com/downl...
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用blast進(jìn)行短序列（20nt左右）的搜索
一句話概括就是：blastn多加上-task blastn-short -word_size 7 -evalue 1就ok了。 這段時(shí)間用blastn比較多，所以遇到這個(gè)問題...
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度量學(xué)習(xí)中的馬氏距離參考博客：協(xié)方差的意義協(xié)方差矩陣的實(shí)例與意義馬氏距離的深入理解馬氏距離(推薦看一下原博) 度量學(xué)習(xí)的主流就是學(xué)習(xí)馬氏距離。這里只先簡單介紹一下馬氏距離中的一些概念和意義。 1...
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多重檢驗(yàn)的目的和方法
目的： 多次檢驗(yàn)導(dǎo)致的大量假陽性1. 如果是小概率事件（< 5%），我們就拋棄了最初的美好假設(shè)（H0：沒有差異），認(rèn)為觀測的和預(yù)期不一樣（接受H1）；2.但是依然有5%的概率...
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FDR 和 q-value
| 轉(zhuǎn)載自G. Corey Shan 的 FDR 和 q-value 最近在做一個(gè)肝癌預(yù)測的項(xiàng)目，建模使用的數(shù)據(jù)源在The Cancer Genome Atlas (TCGA...
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基因家族專題(3)：基因家族成員的鑒定
Data preparation 繼續(xù)上次的內(nèi)容，下載好數(shù)據(jù)后就可以正式開始鑒定了。首先回顧一下，下載好的數(shù)據(jù)。 基因組序列信息，存儲(chǔ)基因組序列信息的.fasta文件。還有其...
