寫在前面 熱圖，或稱熱力圖，是外文 Heatmap 的直譯。在幾乎所有數(shù)值分析相關(guān)工作中都可以看到。生物信息學(xué)數(shù)據(jù)，自然躲不過。無論是形態(tài)數(shù)據(jù)，還是基因拷貝數(shù)數(shù)據(jù)，或是基因表...
發(fā)簡信
IP屬地：湖北
-
收藏貼之一 | 寫過熱圖工具的人，給你理清熱圖數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化 -
R包c(diǎn)lusterProfiler: 轉(zhuǎn)換ID、GO/KEGG富集分析參考這篇ID轉(zhuǎn)換不用怕，clusterProfiler幫你忙這篇詳細(xì)講了無參考基因組該怎么辦，值得一看 簡單介紹一下幾種常用的ID：Ensemble id：一般以ENSG開頭...
-
折騰了許久才復(fù)現(xiàn)出的WGCNA圖-GSE106292你值得擁有
前些天老大布置了WGCNA的作業(yè)：下載GSE106292 數(shù)據(jù)集的 Excel表格如何讀入R里面，做出作者文章中那樣的圖，但是分組很復(fù)雜，需要去文章中找細(xì)節(jié)內(nèi)容，老大jimm...
-
TCGA甲基化芯片數(shù)據(jù)的差異基因的生存分析與富集分析4.將差異甲基化位點(diǎn)拿來做批量生存分析 logrank test批量生存分析 這里和TCGA系列里的內(nèi)容是一樣的，詳見：兩種方法批量做生存分析 得到110個(gè)對生存影響顯著的差...
