本文是百邁客GWAS生物信息培訓(xùn)課程學(xué)習(xí)筆記第二篇,第一篇請(qǐng)參考GWAS基本分析內(nèi)容 這里首先介紹了GWAS分析中常用的統(tǒng)計(jì)學(xué)概念: 1. 假設(shè)檢驗(yàn) 零假設(shè)(H0,null ...
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歡迎關(guān)注”生信修煉手冊(cè)”! TiED是一個(gè)人類(lèi)增強(qiáng)子數(shù)據(jù)庫(kù),對(duì)10種不同組織中的增強(qiáng)子表進(jìn)行定量和分析,鑒定了增強(qiáng)子的組織特異性,網(wǎng)址如下 http://lcbb.swjtu...
參考: [1]. Durand, N.C., et al., Juicer Provides a One-Click System for Analyzing Loop...
這次我們簡(jiǎn)單介紹先ggplot2的拼圖方法,推薦patchwork這個(gè)包,語(yǔ)法簡(jiǎn)單,好用,接下來(lái)我們通過(guò)個(gè)例子來(lái)向大家講述: 其中加是橫著拼圖那么豎著拼圖用除號(hào) 其中 ( |...
(一)什么是聚類(lèi) 聚類(lèi),將相似的事物聚集在一起,將不相似的事物劃分到不同的類(lèi)別的過(guò)程。是將復(fù)雜數(shù)據(jù)簡(jiǎn)化為少數(shù)類(lèi)別的一種手段。 (二)聚類(lèi)的基本思想: 有大量的樣本。 假定研究...
NCBI Ncbi 里包含現(xiàn)在最全的參考基因組數(shù)據(jù),可以進(jìn)入FTP站點(diǎn)查看:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/ 這里的文件夾名為物種的拉丁...
在基因組調(diào)控元件分析中,HOMER 可以用于發(fā)現(xiàn)新的motif。HOMER 通過(guò)比較兩個(gè)序列集,再使用ZOOPS scoring (zero or one occurrenc...