之前寫過一篇細胞類型注釋的推文：單細胞分析實錄(7): 差異表達分析/細胞類型注釋[http://www.itdecent.cn/p/1887dbd8d9e4]，里面介紹了...
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單細胞分析實錄(14): 細胞類型注釋的另一種思路 — CellID
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2020-10-24 RNAseq 從fq開始分析全流程分析流程 1.上傳四個樣本原始就文件到服務器 參考http://www.itdecent.cn/p/a84cd44bac67[http://www.itdecent.cn...
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單細胞108篇文獻解讀之11---SCENIC: 單細胞RNA-seq數據推斷基因調控網絡和細胞功能聚類目前單細胞轉錄組領域用的比較多的細胞聚類方法大多是直接從基因表達矩陣推斷，但是對于多樣本合并分析，很多情況下會出現難以解決的批次效應，例如：有些癌癥多樣本的聚類結果大多每個樣...
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bulk-seq數據和單細胞數據的聯合分析隨著現在研究的不斷深入，越來越多的情況需要我們對多種數據的聯合分析，其中在單細胞沒有出來之前，普通轉錄組（bulk-seq）的測序結果是非常多的，也解決了我們很多的生物學問題...
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單細胞數據擬時分析之VIA（我的優(yōu)勢你們比不了）hello ，童鞋們，今天我們來分享一個有關擬時分析的軟件-----VIA，文章在VIA: Generalized and scalable trajectory infer...
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cellchat-與其他單細胞分析工具的接口
與其他單細胞分析工具包的接口 從Seurat或SingleCellExperiment對象創(chuàng)建CellChat對象[http://www.itdecent.cn/p/cd0...
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cellchat整合多個數據集進行細胞通訊分析Load the required libraries Create a directory to save figures Load CellChat object of ...
