前言 干細(xì)胞(stem cells, SC)是人體內(nèi)具有自我復(fù)制和多向分化潛能的原始細(xì)胞，而這種自我更新和分化為成熟細(xì)胞的能力稱為干性 腫瘤干細(xì)胞 (cancer stem ...
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TCGA 數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn) —— 干性指數(shù)（mRNAsi、mDNAsi）
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幾種常用的差異分析方法簡(jiǎn)介幾種常用的差異分析方法簡(jiǎn)介 如今在生物學(xué)研究中，差異分析越來(lái)越普遍，也有許多做差異分析的方法可供選擇。但是在實(shí)際應(yīng)用中，大多數(shù)人不知道該使用哪種方法來(lái)處理自己的數(shù)據(jù)，所以今天...
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生信小工具專題：BBTools/BBMap Suite 的使用 (2)
接著上一次內(nèi)容繼續(xù)介紹，BBTools、BBMap中的一些實(shí)用的小工具。 BBMap Read Merger 合并雙末端（PE）reads,在預(yù)期中這些reads有重疊的位置...
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生信小工具專題：BBTools/BBMap Suite 的使用 (1)
不會(huì)編程的小白通常會(huì)煩惱怎樣去處理一些簡(jiǎn)單的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)，不要緊其實(shí)日常我們用到百分之80以上的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析，都已經(jīng)有人幫我們將輪子造好了，只要我們學(xué)會(huì)怎樣利用好這些工具，很多事...
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轉(zhuǎn)錄組分析 | 使用STAR進(jìn)行比對(duì)
歡迎關(guān)注微信公眾號(hào)“生信小王子”！ 前幾期，小編已經(jīng)教大家完成了RNA-seq數(shù)據(jù)的質(zhì)控，下面就要正式開始轉(zhuǎn)錄組分析啦！ 通過二代測(cè)序我們可以獲得150bp左右的reads，...
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BWA比對(duì)詳解
bwa主要用于將低差異度的短序列（一般是同物種）與參考基因組進(jìn)行比對(duì)。主要包含三種比對(duì)算法：backtrack、SW和MEM，第一種只支持短序列比對(duì)（<100bp），后兩種支...
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conda的安裝與使用（2021-04-27更新）存檔版2021-04-27 update: 更新了提供conda鏡像的大學(xué)的列表2021-04-13 更新預(yù)告: 本來(lái)打算在閱讀量過40萬(wàn)的時(shí)候更新一遍新的內(nèi)容的. 但是時(shí)間精力實(shí)...
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如何在散點(diǎn)圖里添加特定標(biāo)簽有的時(shí)候我們用ggplot2畫了圖，比如說(shuō)散點(diǎn)圖，那么如何在一堆點(diǎn)里標(biāo)出我們關(guān)注的點(diǎn)呢？ 比如：我想把后兩列用散點(diǎn)圖表示出來(lái)，那么： 如果想改變點(diǎn)的形狀，這里是數(shù)字對(duì)應(yīng)的形狀...
