這里是佳奧！ 2022年的最后一天，讓我們繼續(xù)ATAC-Seq的學(xué)習(xí)！ 1 計(jì)算插入片段長(zhǎng)度 非冗余非線粒體能夠比對(duì)的fragment、比對(duì)率、NRF、PBC1、PBC2、p...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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【ATAC-Seq 實(shí)戰(zhàn)】四、計(jì)算插入片段長(zhǎng)度，F(xiàn)RiP，IDR值與deeptools可視化 -
ATAC-seq專題---生信分析流程ATAC-seq信息分析流程主要分為以下幾個(gè)部分：數(shù)據(jù)質(zhì)控、序列比對(duì)、峰檢測(cè)、motif分析、峰注釋、富集分析，下面將對(duì)各部分內(nèi)容進(jìn)行展開講解。 一、測(cè)序數(shù)據(jù)過濾與質(zhì)量評(píng)估 ...
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SICKLE無法使用 sickle: command not found
可以使用conda 安裝sickle 但是無法使用，也有人有一樣的問題sickle not found though installed. · Issue #58 · naj...
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RseQC報(bào)錯(cuò)ImportError: libhts.so.2: cannot open shared object file
htseq-count運(yùn)行之前需要判斷鏈特異性查閱得知方法為RseQC軟件安裝后報(bào)錯(cuò) 參考Github解決方案[https://github.com/pysam-develo...
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read depth/seq depth/coverage
測(cè)序深度 測(cè)序堿基總量 單端測(cè)序=reads長(zhǎng)度 * reads個(gè)數(shù) 雙端測(cè)序=單端reads長(zhǎng)度 * 單端reads個(gè)數(shù) * 2 通常測(cè)序數(shù)據(jù)量的單位都是用“G"表示，例如...
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insert size&overlap&PE、ME&denovo assembly插入片段 參考網(wǎng)站什么是“插入片段”？ [https://zhuanlan.zhihu.com/p/41782202]插入片段[http://www.bio-info-tra...
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fastq&fasta 處理fastq格式文件處理大全[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI2MjA1MDQxMg==&mid=2649709428&idx=1&sn...
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轉(zhuǎn)錄組分析流程mRNA生信分析常規(guī)流程 [https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUwOTg0MjczNw==&mid=2247489620&idx=1&sn...
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一二三代測(cè)序技術(shù)原理簡(jiǎn)介第一、第二、第三代測(cè)序原理[https://www.bilibili.com/video/BV1oa4y1H7CU/?t=31&vd_source=4525116f3ef07...
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