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240 發(fā)簡信
IP屬地:河南
  • @Caspare 可以呀

    使用GATK從RNA-seq數(shù)據(jù)中call variants

    GATK官方給出了從RNA-seq數(shù)據(jù)中尋找變異位點(diǎn)的流程,但這個(gè)示意圖比較簡潔,實(shí)際操作時(shí)一不小心就會(huì)報(bào)錯(cuò),故經(jīng)過探索,記錄下這個(gè)流程的細(xì)節(jié)以及半自動(dòng)化的腳本。 1. 軟件...

  • @Caspare 如果測序質(zhì)量很好的話不進(jìn)行BQSR沒關(guān)系的 至于VQSR 其實(shí)是對變異過濾的方法 一般在基因組測序分析的時(shí)候用 RNAseq分析流程中 GATK官方給出的流程是用硬過濾的方法

    使用GATK從RNA-seq數(shù)據(jù)中call variants

    GATK官方給出了從RNA-seq數(shù)據(jù)中尋找變異位點(diǎn)的流程,但這個(gè)示意圖比較簡潔,實(shí)際操作時(shí)一不小心就會(huì)報(bào)錯(cuò),故經(jīng)過探索,記錄下這個(gè)流程的細(xì)節(jié)以及半自動(dòng)化的腳本。 1. 軟件...

  • @J_445a 主要看后續(xù)研究目的吧 我們課題不太關(guān)注intron上的變異 所以就沒管他們

    使用GATK從RNA-seq數(shù)據(jù)中call variants

    GATK官方給出了從RNA-seq數(shù)據(jù)中尋找變異位點(diǎn)的流程,但這個(gè)示意圖比較簡潔,實(shí)際操作時(shí)一不小心就會(huì)報(bào)錯(cuò),故經(jīng)過探索,記錄下這個(gè)流程的細(xì)節(jié)以及半自動(dòng)化的腳本。 1. 軟件...

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    使用GATK從RNA-seq數(shù)據(jù)中call variants

    GATK官方給出了從RNA-seq數(shù)據(jù)中尋找變異位點(diǎn)的流程,但這個(gè)示意圖比較簡潔,實(shí)際操作時(shí)一不小心就會(huì)報(bào)錯(cuò),故經(jīng)過探索,記錄下這個(gè)流程的細(xì)節(jié)以及半自動(dòng)化的腳本。 1. 軟件...

  • 面試官的話等于有沒有在服務(wù)器上裝過軟件?

    服務(wù)器 | 又雙買了一個(gè)服務(wù)器

    第一個(gè)服務(wù)器:2016.10 第二個(gè)服務(wù)器:2018.12 配置流程及問題: 從服務(wù)器聯(lián)系購買,配置,到網(wǎng)絡(luò)搭建(固定id,同一個(gè)路由),到主要分析環(huán)境搭建,基本上都是我一手...

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    收集 | 實(shí)用軟件推薦

    序言 事半功倍的前提是對某一些東西有一定程度的了解。厚積薄發(fā)需要時(shí)間的歷練?;仡欉@一年多以來,不禁反思,我的時(shí)間究竟去了哪里?答案是需要總結(jié)。 截圖軟件 習(xí)慣了QQ的截圖快捷...

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