上一篇我們講了傳統(tǒng)venn圖的畫(huà)法，今天測(cè)試另外一個(gè)包VennDetail，有點(diǎn)還是它綜合了upset，從而能處理大于5維的數(shù)據(jù)。 首先沒(méi)有安裝的話，安裝這個(gè)包。 libra...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：寧夏
-
【R畫(huà)圖學(xué)習(xí)6.2】Venn圖---VennDetail -
cel格式的芯片原始數(shù)據(jù)處理
收到一個(gè)學(xué)生求助，得到空的表達(dá)矩陣，限于目前初學(xué)的狀態(tài)，處理原始數(shù)據(jù)比較困難，但又急用，這不，我來(lái)幫忙咯。 1.初步探索 表達(dá)矩陣確實(shí)是空的，不過(guò)附件里提供了cel格式的原始...
-
使用R下載HPA數(shù)據(jù)庫(kù)的免疫組化數(shù)據(jù)
HPA數(shù)據(jù)庫(kù)有豐富的切片數(shù)據(jù)和免疫組化的切片，可以從網(wǎng)站一個(gè)個(gè)下載保存，然后把對(duì)應(yīng)的信息保存，再重命名，再次比對(duì)信息。 但是，這樣的操作，可謂耗時(shí)耗力，還有可能在對(duì)比的時(shí)候出...
-
數(shù)據(jù)分析：RT-qPCR分析介紹 做完轉(zhuǎn)錄組分析之后，一般都要求做qRT-PCR來(lái)驗(yàn)證二代測(cè)序得到的轉(zhuǎn)錄本表達(dá)是否可靠。熒光定量PCR是一種相對(duì)表達(dá)定量的方法，他的計(jì)算方法有很多，常用的相對(duì)定量數(shù)據(jù)分析...
-
TCGA的ID轉(zhuǎn)換可以一步到位了
0.背景知識(shí) TCGA或TCGA+GTEx的表達(dá)矩陣，行名都是ensamble id，因?yàn)門(mén)CGA數(shù)據(jù)的參考基因組版本是genecode V22，xena重新分析的TCGA+...
-
TCGA學(xué)習(xí)03：生存分析TCGA學(xué)習(xí)01：數(shù)據(jù)下載與整理 - 簡(jiǎn)書(shū) [http://www.itdecent.cn/p/79816a20cbb1]TCGA學(xué)習(xí)02：差異分析 - 簡(jiǎn)書(shū) [htt...
