在生信文章中，我們經(jīng)常會(huì)見到看起來(lái)很賽博朋克的?；鶊D——豐富色彩的虛實(shí)結(jié)合，高級(jí)感滿滿。如圖1，一些ceRNA網(wǎng)絡(luò)相關(guān)的文獻(xiàn)就會(huì)用?；鶊D來(lái)直觀的展示lncRNA、miRNA、...
發(fā)簡(jiǎn)信
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什么！繪制?；鶊D也有傻瓜式的操作啦？教你提升Figure的豐富度！ -
多組學(xué)水平的孟德爾隨機(jī)化分析+three-step SMR 應(yīng)用實(shí)操
多組學(xué)分析：在基因表達(dá)、表觀遺傳、蛋白、單細(xì)胞及微生物組學(xué)等水平上，利用組學(xué)數(shù)據(jù)比較不同組學(xué)水平的疾病和健康對(duì)照，從而鑒定潛在的致病機(jī)制。 藥物靶點(diǎn)孟德爾隨機(jī)化分析：探究是其...
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兩大經(jīng)典數(shù)據(jù)來(lái)源，帶你輕松搞定蛋白質(zhì)組學(xué)！
前面的推文（多組學(xué)聯(lián)合應(yīng)用···[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg2ODk3NDkxOA==&mid=2247484306&idx=1&...
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保姆級(jí)教程！5分鐘學(xué)會(huì)繪制timeROC、multiROC（附示例數(shù)據(jù)）！文獻(xiàn)中常見的ROC曲線有兩種，一種是多時(shí)間點(diǎn)ROC（timeROC），是不同時(shí)間點(diǎn)下的ROC，最常見的為1、3、5年，如圖1；一種是多指標(biāo)ROC（multiROC），是不同變...
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手把手教你從GSEA下載目標(biāo)基因集并使用maftools包繪制瀑布圖！很多情況下，我們進(jìn)行生信分析都會(huì)有一個(gè)感興趣的點(diǎn)，可以是免疫、m6A甲基化、鐵死亡、銅死亡等等，但有很多小伙伴不知道到哪里去尋找并下載目標(biāo)基因集。本期推文，小碗不僅會(huì)給大家介...
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單因素、多因素COX回歸分析在R中的實(shí)現(xiàn)與常見問(wèn)題解答在生信分析的過(guò)程中，單因素、多因素COX回歸分析常用來(lái)篩選與患者預(yù)后有關(guān)的因素，相信很多小伙伴對(duì)此并不陌生。那么，如何在R中進(jìn)行單因素、多因素COX回歸分析？COX回歸分析與...
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GEO2R的limma差異分析流程【芯片microarray數(shù)據(jù)】附limma+RNAseq參考學(xué)習(xí)GEO提供的GEO2R在線差異分析工具使用的代碼流程。筆記里的代碼在理解每一步的基礎(chǔ)上，部分做了修改。但大致思路不變，即使用limma包對(duì)芯片測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行差異分析(暫...
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實(shí)戰(zhàn)-TCGA數(shù)據(jù)的NMF聚類和可視化0.NMF NMF是非負(fù)矩陣分解，也是常用的劃分亞組（亞型）的聚類方法之一咯。 代碼主要參考了幫助文檔和曾老板的博客：http://www.bio-info-trainee....
