在生信文章中,我們經(jīng)常會(huì)見到看起來(lái)很賽博朋克的?;鶊D——豐富色彩的虛實(shí)結(jié)合,高級(jí)感滿滿。如圖1,一些ceRNA網(wǎng)絡(luò)相關(guān)的文獻(xiàn)就會(huì)用?;鶊D來(lái)直觀的展示lncRNA、miRNA、...
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多組學(xué)分析:在基因表達(dá)、表觀遺傳、蛋白、單細(xì)胞及微生物組學(xué)等水平上,利用組學(xué)數(shù)據(jù)比較不同組學(xué)水平的疾病和健康對(duì)照,從而鑒定潛在的致病機(jī)制。 藥物靶點(diǎn)孟德爾隨機(jī)化分析:探究是其...
前面的推文(多組學(xué)聯(lián)合應(yīng)用···[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg2ODk3NDkxOA==&mid=2247484306&idx=1&...
文獻(xiàn)中常見的ROC曲線有兩種,一種是多時(shí)間點(diǎn)ROC(timeROC),是不同時(shí)間點(diǎn)下的ROC,最常見的為1、3、5年,如圖1;一種是多指標(biāo)ROC(multiROC),是不同變...
很多情況下,我們進(jìn)行生信分析都會(huì)有一個(gè)感興趣的點(diǎn),可以是免疫、m6A甲基化、鐵死亡、銅死亡等等,但有很多小伙伴不知道到哪里去尋找并下載目標(biāo)基因集。本期推文,小碗不僅會(huì)給大家介...
在生信分析的過(guò)程中,單因素、多因素COX回歸分析常用來(lái)篩選與患者預(yù)后有關(guān)的因素,相信很多小伙伴對(duì)此并不陌生。那么,如何在R中進(jìn)行單因素、多因素COX回歸分析?COX回歸分析與...
參考學(xué)習(xí)GEO提供的GEO2R在線差異分析工具使用的代碼流程。筆記里的代碼在理解每一步的基礎(chǔ)上,部分做了修改。但大致思路不變,即使用limma包對(duì)芯片測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行差異分析(暫...
0.NMF NMF是非負(fù)矩陣分解,也是常用的劃分亞組(亞型)的聚類方法之一咯。 代碼主要參考了幫助文檔和曾老板的博客:http://www.bio-info-trainee....