今天有一個需求,就是要將gtf中的轉(zhuǎn)錄本轉(zhuǎn)成fasta序列,一開始是想著用bedtools getfasta實現(xiàn),awk取出來坐標做成bed文件輸入bedtools,但是結(jié)果...
今天有一個需求,就是要將gtf中的轉(zhuǎn)錄本轉(zhuǎn)成fasta序列,一開始是想著用bedtools getfasta實現(xiàn),awk取出來坐標做成bed文件輸入bedtools,但是結(jié)果...
序列比對和序列特征分析總目錄 啟動子Promoter是位于基因5'端上游的DNA序列,調(diào)控基因表達。作用方式是通過與轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合。關(guān)于啟動子更詳細的簡文請看查找一個基因的啟動...
海盜灣(The Pirate Bay,縮寫:TPB)是由瑞典的一個民間反版權(quán)組織海盜署(Piratbyr?n)成立于2003年,最初僅為瑞典語站點。后來發(fā)展成為獨立的組織,2...
更新:20190319 使用EasyCodeML完成dnds的計算,自己嘗試了分支模型和位點模型的計算,簡直不要太容易! 更新:20190314 教程 http://wiki...
前言 最近在看一些關(guān)于生態(tài)、遺傳、基因組進化等的文獻,其中有個很多人用的也用了很久的用以判斷物種選擇壓力的數(shù)值,(Ka/Ks)。發(fā)現(xiàn)在國內(nèi)的資料中比較少,即使有,也只是教大家...
mpileup是samtools的一個命令,用來生存bcf文件,然后再用bcftools進行SNP和Indel的分析。另外,bcftools是samtools的附帶軟件。 1...
在線工具一般具有“功能強大、操作簡單、無需安裝、用完就走”的特點,輕松實現(xiàn)“用別人的服務器分析自己的數(shù)據(jù)”。 基因結(jié)構(gòu)繪制 1.Exon-Intron Graphic Mak...
1.genome survey 數(shù)據(jù)過濾去除測序原始數(shù)據(jù)中可能包含低質(zhì)量、接頭污染以及含 N 過高的 reads NT比對通過BLAST對下機數(shù)據(jù)過濾后的有效數(shù)據(jù)進行 NT ...