今天有一個需求，就是要將gtf中的轉(zhuǎn)錄本轉(zhuǎn)成fasta序列，一開始是想著用bedtools getfasta實現(xiàn)，awk取出來坐標做成bed文件輸入bedtools，但是結(jié)果...
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gffread - gtf/gff文件轉(zhuǎn)fasta序列 -
4?? 核酸序列特征分析(3):啟動子及轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點預測和轉(zhuǎn)錄終止信號預測序列比對和序列特征分析總目錄 啟動子Promoter是位于基因5'端上游的DNA序列，調(diào)控基因表達。作用方式是通過與轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合。關(guān)于啟動子更詳細的簡文請看查找一個基因的啟動...
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最佳BT種子下載網(wǎng)站（2018年）海盜灣（The Pirate Bay，縮寫：TPB）是由瑞典的一個民間反版權(quán)組織海盜署（Piratbyr?n）成立于2003年，最初僅為瑞典語站點。后來發(fā)展成為獨立的組織，2...
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paml計算dn/ds的小實例更新：20190319 使用EasyCodeML完成dnds的計算，自己嘗試了分支模型和位點模型的計算，簡直不要太容易！ 更新：20190314 教程 http://wiki...
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用以判斷選擇壓力的Ka/Ks的計算前言 最近在看一些關(guān)于生態(tài)、遺傳、基因組進化等的文獻，其中有個很多人用的也用了很久的用以判斷物種選擇壓力的數(shù)值，（Ka/Ks）。發(fā)現(xiàn)在國內(nèi)的資料中比較少，即使有，也只是教大家...
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mpileup命令參數(shù)和結(jié)果詳解
mpileup是samtools的一個命令，用來生存bcf文件，然后再用bcftools進行SNP和Indel的分析。另外，bcftools是samtools的附帶軟件。 1...
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48個實用的生信在線工具
在線工具一般具有“功能強大、操作簡單、無需安裝、用完就走”的特點，輕松實現(xiàn)“用別人的服務器分析自己的數(shù)據(jù)”。 基因結(jié)構(gòu)繪制 1.Exon-Intron Graphic Mak...
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基因組文章構(gòu)成1.genome survey 數(shù)據(jù)過濾去除測序原始數(shù)據(jù)中可能包含低質(zhì)量、接頭污染以及含 N 過高的 reads NT比對通過BLAST對下機數(shù)據(jù)過濾后的有效數(shù)據(jù)進行 NT ...
