發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：北京
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ClusterGVis: Heatmap+Mfuzz+GO/KEGGClusterGVis是一個(gè)基因表達(dá)數(shù)據(jù)可視化的R包，由中國(guó)藥科大學(xué)Jun Zhang博士開(kāi)發(fā)，可以同時(shí)繪制聚類+分組表達(dá)趨勢(shì)折線圖+功能注釋的...
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基因組重測(cè)序分析干貨### 一般從測(cè)序公司拿到的下級(jí)數(shù)據(jù)有raw data，或者經(jīng)過(guò)質(zhì)控之后的clean data，格式為fq。參考基因組及注釋文件gff從網(wǎng)上下載...
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如何上傳轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)到NCBI的SRA數(shù)據(jù)庫(kù)
建議大家把數(shù)據(jù)上傳到我們自己的數(shù)據(jù)庫(kù)（http://bigd.big.ac.cn/），支持國(guó)產(chǎn)。由于我的數(shù)據(jù)太差了，還是傳到NCBI吧~ 第一步...
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國(guó)內(nèi)第一篇植物單細(xì)胞測(cè)序
之前關(guān)注王佳偉在植物發(fā)育階段轉(zhuǎn)變過(guò)程中調(diào)控機(jī)制的研究，洲更在生信界也是大名頂頂，不知道他們是一個(gè)課題組的。用到的統(tǒng)計(jì)方法有：t-SNE和UMAP...
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SOAPdenowoSOAPdenovo是一個(gè)新穎的適用于組裝短reads的方法，能組裝出類似人類基因組大小的de novo草圖。該軟件特地設(shè)計(jì)用來(lái)組裝Illumi...
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一個(gè)糾結(jié)的晚上
前天文章終于online了，本來(lái)是個(gè)好消息，卻高興不起來(lái)。因?yàn)椴皇前凑兆钚掳姹?，有幾個(gè)錯(cuò)誤沒(méi)改過(guò)來(lái)。 9.5我把修改好的最終版本郵件發(fā)給編輯，為...
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GO 和 KEGG 注釋之前，為什么要先進(jìn)行序列比對(duì)（BLAST）？
在進(jìn)行功能注釋和通路注釋之前，我們會(huì)先將差異蛋白與合適的數(shù)據(jù)庫(kù)中的蛋白序列進(jìn)行比對(duì)。目的一：很多物種目前研究的程度還很有限，關(guān)于這些物種的蛋白注...
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filled.contour繪制柵格圖今天幫一個(gè)同學(xué)做了幾個(gè)圖，用到filled.contour這個(gè)函數(shù)，在一個(gè)有點(diǎn)傻的地方耗費(fèi)了我大量精力。最后保存作圖的時(shí)候如果保存成pdf 格式...
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陪小寶讀書(shū)之百年孤獨(dú)
這本書(shū)的復(fù)雜性就跟百年孤獨(dú)這個(gè)名字一樣，要把一百年的孤獨(dú)寫(xiě)盡，該是一部怎樣壯烈的文辭。 這是一部無(wú)關(guān)愛(ài)情的浪漫的書(shū)，每個(gè)人都在用自己的方式孤獨(dú)著...
個(gè)人介紹
更多關(guān)于生信，特別是統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)與生物信息學(xué)請(qǐng)關(guān)注知識(shí)星球-生信搬磚工，在那里我會(huì)不定期跟大家分享一些高質(zhì)量文獻(xiàn)，特別是本實(shí)驗(yàn)室發(fā)表的高水平論文，Many thanks.