16SrRNA 基因通常作為分子標記進行微生物群落結構的研究，但是它有一些明顯的限制，比如16S rRNA基因在物種中會有多個拷貝，而且，由于16S rRNA基因的進化速率較...
發(fā)簡信
IP屬地：重慶
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Fungene分析流程比較以nifH為例 -
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您好，用figaro分析截斷位置所用的數(shù)據(jù)是未去除引物序列的，而dada2處理的是去除引物的，這個截取位置會不會變化？
一文完不成qiime2微生物多樣性分析(2021版上)
之前寫過一系列qiim2的教程都是零零散散的記錄，里面也有不少命令打錯的步驟給各位小伙伴造成了不少的疑惑，恰逢qiime2-2020.11發(fā)布，所以就在重新總結一次，這次稍后...
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Enterotypes of the human gut microbiome德國海德爾堡發(fā)表在Nature上的第一篇腸型分析 對于人類腸道微生物的了解快速增長，但是這些認識仍是基于很少一部分的人群的，世界范圍上的差異并不清楚。從來自四個國家的22個分...
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NG | 孟德爾隨機分析菌群&代謝物因果關系文章標題：Mendelian randomization analyses support causal relationships between blood metabo...
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2019-02-13批量將文件以文件夾名字命名
運用SPAdes拼接完細菌基因組候，拼接完的結果保存在OutFileName/contigs.fasta，通常需要重命名然后下載到本地計算機進一步分析。在樣本多的情況下，批處...
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決定用四年的時間記錄自己的成長；<br>女孩子也可以努力的很漂亮；<br>喜歡的東西都很貴，所以要加油呀。<br>VX公共號：學生菌口替代表
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review-腸道菌群與不健康衰老：區(qū)分原因與后果summary 現(xiàn)狀： 1.腸道菌群會隨著年齡改變，但是這種變化是由于生理變化、免疫衰老、炎癥、飲食、藥物還是長期的健康情況引起的尚不明確 2.發(fā)現(xiàn)腸道菌群與長壽人群有密切關...
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教你畫一個掰彎的熱圖（Heatmap），展示更多的基因表達量難道，這不像孔雀開屏嗎？ 寫在前面 組學數(shù)據(jù)已經(jīng)泛濫，但是信息的挖掘仍任重道遠。順手的工具，可以節(jié)省使用者盡可能多的時間，或者將看起來很復雜，很難以完成的事情，變得非常簡單。...
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收集一些生物信息學的分析流程的文章。感謝這些簡友整理的生信分析流程！ 如果簡友投稿沒有被我收入專題，可能是我沒看到或者收入到其他針對性更強的專題中了。望見諒！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的，查看的時候請點擊“最新收錄”然后進行查看。 ?? 全基因組測序(WGS)分析 ?? 轉錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質免疫共沉淀技術ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 ?? 單細胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預后標志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進化樹構建與分析 ?? 群體遺傳學分析 ?? 全基因組關聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細節(jié)的比如熱圖、曼哈頓圖的繪制等 ?? python、perl、R的包的使用過程 ?? 具體工具的使用，比如GATK的使用過程 ?? 數(shù)據(jù)庫的挖掘方法，比如TCGA數(shù)據(jù)庫的使用 ?? 另外就是整個文章走下來的流程 ?? ?? ??
